Protein–RNA interactions for Protein: H3BNH8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BNH8 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
H3BNH8 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
H3BNH8 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
H3BNH8 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
H3BNH8 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
H3BNH8 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
H3BNH8 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
H3BNH8 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
H3BNH8 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
H3BNH8 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
H3BNH8 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
H3BNH8 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
H3BNH8 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
H3BNH8 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
H3BNH8 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
H3BNH8 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
H3BNH8 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
H3BNH8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
H3BNH8 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
H3BNH8 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
H3BNH8 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
H3BNH8 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
H3BNH8 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
H3BNH8 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
H3BNH8 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
H3BNH8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
H3BNH8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
H3BNH8 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
H3BNH8 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
H3BNH8 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
H3BNH8 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
H3BNH8 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
H3BNH8 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
H3BNH8 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
H3BNH8 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
H3BNH8 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
H3BNH8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
H3BNH8 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
H3BNH8 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
H3BNH8 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
H3BNH8 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
H3BNH8 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
H3BNH8 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
H3BNH8 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
H3BNH8 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
H3BNH8 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
H3BNH8 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
H3BNH8 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
H3BNH8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
H3BNH8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
H3BNH8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
H3BNH8 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
H3BNH8 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
H3BNH8 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
H3BNH8 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
H3BNH8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
H3BNH8 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
H3BNH8 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
H3BNH8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
H3BNH8 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
H3BNH8 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
H3BNH8 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
H3BNH8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
H3BNH8 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
H3BNH8 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
H3BNH8 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
H3BNH8 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
H3BNH8 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
H3BNH8 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
H3BNH8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
H3BNH8 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
H3BNH8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
H3BNH8 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
H3BNH8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
H3BNH8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
H3BNH8 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
H3BNH8 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
H3BNH8 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
H3BNH8 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
H3BNH8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
H3BNH8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
H3BNH8 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
H3BNH8 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
H3BNH8 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
H3BNH8 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
H3BNH8 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
H3BNH8 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
H3BNH8 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
H3BNH8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
H3BNH8 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
H3BNH8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
H3BNH8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
H3BNH8 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
H3BNH8 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
H3BNH8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
H3BNH8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
H3BNH8 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
H3BNH8 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
H3BNH8 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
H3BNH8 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms