Protein–RNA interactions for Protein: A6NI87

CBY3, Protein chibby homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBY3A6NI87 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CBY3A6NI87 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CBY3A6NI87 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CBY3A6NI87 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CBY3A6NI87 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CBY3A6NI87 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CBY3A6NI87 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CBY3A6NI87 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CBY3A6NI87 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CBY3A6NI87 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CBY3A6NI87 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CBY3A6NI87 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CBY3A6NI87 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CBY3A6NI87 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CBY3A6NI87 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CBY3A6NI87 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CBY3A6NI87 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CBY3A6NI87 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CBY3A6NI87 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CBY3A6NI87 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CBY3A6NI87 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CBY3A6NI87 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CBY3A6NI87 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CBY3A6NI87 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CBY3A6NI87 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CBY3A6NI87 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CBY3A6NI87 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CBY3A6NI87 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CBY3A6NI87 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CBY3A6NI87 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CBY3A6NI87 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CBY3A6NI87 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CBY3A6NI87 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CBY3A6NI87 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CBY3A6NI87 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CBY3A6NI87 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CBY3A6NI87 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CBY3A6NI87 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CBY3A6NI87 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CBY3A6NI87 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CBY3A6NI87 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CBY3A6NI87 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CBY3A6NI87 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CBY3A6NI87 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CBY3A6NI87 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CBY3A6NI87 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CBY3A6NI87 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CBY3A6NI87 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CBY3A6NI87 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CBY3A6NI87 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CBY3A6NI87 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CBY3A6NI87 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CBY3A6NI87 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CBY3A6NI87 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CBY3A6NI87 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CBY3A6NI87 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CBY3A6NI87 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CBY3A6NI87 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CBY3A6NI87 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CBY3A6NI87 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CBY3A6NI87 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CBY3A6NI87 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CBY3A6NI87 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CBY3A6NI87 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CBY3A6NI87 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CBY3A6NI87 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CBY3A6NI87 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CBY3A6NI87 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CBY3A6NI87 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CBY3A6NI87 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CBY3A6NI87 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CBY3A6NI87 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CBY3A6NI87 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CBY3A6NI87 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CBY3A6NI87 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CBY3A6NI87 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CBY3A6NI87 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CBY3A6NI87 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CBY3A6NI87 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CBY3A6NI87 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CBY3A6NI87 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CBY3A6NI87 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CBY3A6NI87 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CBY3A6NI87 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CBY3A6NI87 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CBY3A6NI87 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CBY3A6NI87 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CBY3A6NI87 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CBY3A6NI87 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CBY3A6NI87 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CBY3A6NI87 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CBY3A6NI87 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CBY3A6NI87 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CBY3A6NI87 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CBY3A6NI87 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CBY3A6NI87 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CBY3A6NI87 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CBY3A6NI87 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CBY3A6NI87 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CBY3A6NI87 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.6 ms