Protein–RNA interactions for Protein: A6NGG3

C9orf92, Putative uncharacterized protein C9orf92, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf92A6NGG3 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf92A6NGG3 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf92A6NGG3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf92A6NGG3 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf92A6NGG3 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf92A6NGG3 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf92A6NGG3 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf92A6NGG3 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf92A6NGG3 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf92A6NGG3 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf92A6NGG3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf92A6NGG3 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf92A6NGG3 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf92A6NGG3 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf92A6NGG3 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf92A6NGG3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf92A6NGG3 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf92A6NGG3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf92A6NGG3 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
C9orf92A6NGG3 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf92A6NGG3 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC15.08■□□□□ 0
C9orf92A6NGG3 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf92A6NGG3 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf92A6NGG3 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf92A6NGG3 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf92A6NGG3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf92A6NGG3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf92A6NGG3 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf92A6NGG3 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf92A6NGG3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf92A6NGG3 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf92A6NGG3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C9orf92A6NGG3 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
C9orf92A6NGG3 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ 0
C9orf92A6NGG3 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf92A6NGG3 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C9orf92A6NGG3 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf92A6NGG3 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf92A6NGG3 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C9orf92A6NGG3 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C9orf92A6NGG3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C9orf92A6NGG3 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC15.02■□□□□ -0
C9orf92A6NGG3 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C9orf92A6NGG3 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
C9orf92A6NGG3 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
C9orf92A6NGG3 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
C9orf92A6NGG3 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
C9orf92A6NGG3 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
C9orf92A6NGG3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
C9orf92A6NGG3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
C9orf92A6NGG3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
C9orf92A6NGG3 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
C9orf92A6NGG3 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
C9orf92A6NGG3 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
C9orf92A6NGG3 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
C9orf92A6NGG3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
C9orf92A6NGG3 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
C9orf92A6NGG3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
C9orf92A6NGG3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
C9orf92A6NGG3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
C9orf92A6NGG3 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
C9orf92A6NGG3 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
C9orf92A6NGG3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
C9orf92A6NGG3 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
C9orf92A6NGG3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
C9orf92A6NGG3 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
C9orf92A6NGG3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
C9orf92A6NGG3 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
C9orf92A6NGG3 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C9orf92A6NGG3 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C9orf92A6NGG3 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
C9orf92A6NGG3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C9orf92A6NGG3 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C9orf92A6NGG3 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C9orf92A6NGG3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C9orf92A6NGG3 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C9orf92A6NGG3 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
C9orf92A6NGG3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
C9orf92A6NGG3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
C9orf92A6NGG3 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf92A6NGG3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf92A6NGG3 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf92A6NGG3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
C9orf92A6NGG3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
C9orf92A6NGG3 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
C9orf92A6NGG3 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
C9orf92A6NGG3 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
C9orf92A6NGG3 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
C9orf92A6NGG3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
C9orf92A6NGG3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
C9orf92A6NGG3 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
C9orf92A6NGG3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
C9orf92A6NGG3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
C9orf92A6NGG3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
C9orf92A6NGG3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
C9orf92A6NGG3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
C9orf92A6NGG3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
C9orf92A6NGG3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
C9orf92A6NGG3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf92A6NGG3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms