Protein–RNA interactions for Protein: A4UGR9

XIRP2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP2A4UGR9 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
XIRP2A4UGR9 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
XIRP2A4UGR9 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
XIRP2A4UGR9 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
XIRP2A4UGR9 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
XIRP2A4UGR9 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
XIRP2A4UGR9 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
XIRP2A4UGR9 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
XIRP2A4UGR9 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
XIRP2A4UGR9 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
XIRP2A4UGR9 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.22■■■□□ 2.27
XIRP2A4UGR9 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC29.19■■■□□ 2.26
XIRP2A4UGR9 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
XIRP2A4UGR9 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
XIRP2A4UGR9 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
XIRP2A4UGR9 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
XIRP2A4UGR9 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
XIRP2A4UGR9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
XIRP2A4UGR9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
XIRP2A4UGR9 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
XIRP2A4UGR9 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
XIRP2A4UGR9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
XIRP2A4UGR9 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
XIRP2A4UGR9 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
XIRP2A4UGR9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
XIRP2A4UGR9 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
XIRP2A4UGR9 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
XIRP2A4UGR9 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
XIRP2A4UGR9 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
XIRP2A4UGR9 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
XIRP2A4UGR9 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
XIRP2A4UGR9 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
XIRP2A4UGR9 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
XIRP2A4UGR9 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
XIRP2A4UGR9 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
XIRP2A4UGR9 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
XIRP2A4UGR9 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
XIRP2A4UGR9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
XIRP2A4UGR9 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
XIRP2A4UGR9 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
XIRP2A4UGR9 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
XIRP2A4UGR9 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
XIRP2A4UGR9 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
XIRP2A4UGR9 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
XIRP2A4UGR9 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
XIRP2A4UGR9 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
XIRP2A4UGR9 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC29■■■□□ 2.23
XIRP2A4UGR9 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
XIRP2A4UGR9 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
XIRP2A4UGR9 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
XIRP2A4UGR9 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
XIRP2A4UGR9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
XIRP2A4UGR9 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
XIRP2A4UGR9 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
XIRP2A4UGR9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
XIRP2A4UGR9 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
XIRP2A4UGR9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
XIRP2A4UGR9 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
XIRP2A4UGR9 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
XIRP2A4UGR9 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
XIRP2A4UGR9 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
XIRP2A4UGR9 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
XIRP2A4UGR9 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
XIRP2A4UGR9 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
XIRP2A4UGR9 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
XIRP2A4UGR9 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
XIRP2A4UGR9 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
XIRP2A4UGR9 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
XIRP2A4UGR9 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
XIRP2A4UGR9 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
XIRP2A4UGR9 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
XIRP2A4UGR9 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
XIRP2A4UGR9 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
XIRP2A4UGR9 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
XIRP2A4UGR9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
XIRP2A4UGR9 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
XIRP2A4UGR9 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
XIRP2A4UGR9 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
XIRP2A4UGR9 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
XIRP2A4UGR9 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
XIRP2A4UGR9 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.79■■■□□ 2.2
XIRP2A4UGR9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
XIRP2A4UGR9 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
XIRP2A4UGR9 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
XIRP2A4UGR9 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
XIRP2A4UGR9 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
XIRP2A4UGR9 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
XIRP2A4UGR9 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
XIRP2A4UGR9 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
XIRP2A4UGR9 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
XIRP2A4UGR9 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
XIRP2A4UGR9 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
XIRP2A4UGR9 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
XIRP2A4UGR9 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
XIRP2A4UGR9 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
XIRP2A4UGR9 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
XIRP2A4UGR9 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
XIRP2A4UGR9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
XIRP2A4UGR9 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
XIRP2A4UGR9 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.7 ms