Protein–RNA interactions for Protein: A0A1W2PQ72

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1W2PQ72 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
A0A1W2PQ72 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
A0A1W2PQ72 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
A0A1W2PQ72 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
A0A1W2PQ72 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
A0A1W2PQ72 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
A0A1W2PQ72 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
A0A1W2PQ72 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
A0A1W2PQ72 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
A0A1W2PQ72 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
A0A1W2PQ72 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
A0A1W2PQ72 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
A0A1W2PQ72 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
A0A1W2PQ72 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
A0A1W2PQ72 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
A0A1W2PQ72 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
A0A1W2PQ72 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
A0A1W2PQ72 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
A0A1W2PQ72 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
A0A1W2PQ72 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
A0A1W2PQ72 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
A0A1W2PQ72 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
A0A1W2PQ72 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
A0A1W2PQ72 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
A0A1W2PQ72 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
A0A1W2PQ72 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
A0A1W2PQ72 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
A0A1W2PQ72 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
A0A1W2PQ72 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
A0A1W2PQ72 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
A0A1W2PQ72 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
A0A1W2PQ72 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
A0A1W2PQ72 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
A0A1W2PQ72 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
A0A1W2PQ72 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
A0A1W2PQ72 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
A0A1W2PQ72 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
A0A1W2PQ72 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
A0A1W2PQ72 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
A0A1W2PQ72 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
A0A1W2PQ72 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
A0A1W2PQ72 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
A0A1W2PQ72 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
A0A1W2PQ72 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
A0A1W2PQ72 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
A0A1W2PQ72 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
A0A1W2PQ72 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
A0A1W2PQ72 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
A0A1W2PQ72 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
A0A1W2PQ72 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
A0A1W2PQ72 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
A0A1W2PQ72 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
A0A1W2PQ72 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
A0A1W2PQ72 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
A0A1W2PQ72 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
A0A1W2PQ72 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
A0A1W2PQ72 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
A0A1W2PQ72 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
A0A1W2PQ72 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
A0A1W2PQ72 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
A0A1W2PQ72 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
A0A1W2PQ72 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
A0A1W2PQ72 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
A0A1W2PQ72 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
A0A1W2PQ72 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
A0A1W2PQ72 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
A0A1W2PQ72 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
A0A1W2PQ72 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
A0A1W2PQ72 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
A0A1W2PQ72 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
A0A1W2PQ72 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
A0A1W2PQ72 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
A0A1W2PQ72 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
A0A1W2PQ72 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
A0A1W2PQ72 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
A0A1W2PQ72 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
A0A1W2PQ72 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
A0A1W2PQ72 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
A0A1W2PQ72 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
A0A1W2PQ72 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
A0A1W2PQ72 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
A0A1W2PQ72 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
A0A1W2PQ72 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
A0A1W2PQ72 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
A0A1W2PQ72 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
A0A1W2PQ72 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
A0A1W2PQ72 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
A0A1W2PQ72 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
A0A1W2PQ72 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
A0A1W2PQ72 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
A0A1W2PQ72 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
A0A1W2PQ72 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
A0A1W2PQ72 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
A0A1W2PQ72 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
A0A1W2PQ72 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
A0A1W2PQ72 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
A0A1W2PQ72 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
A0A1W2PQ72 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
A0A1W2PQ72 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
A0A1W2PQ72 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms