Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J2A2

PPIAL4C, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase A-like 4C, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPIAL4CA0A0B4J2A2 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPIAL4CA0A0B4J2A2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPIAL4CA0A0B4J2A2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PPIAL4CA0A0B4J2A2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPIAL4CA0A0B4J2A2 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPIAL4CA0A0B4J2A2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPIAL4CA0A0B4J2A2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPIAL4CA0A0B4J2A2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPIAL4CA0A0B4J2A2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPIAL4CA0A0B4J2A2 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPIAL4CA0A0B4J2A2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPIAL4CA0A0B4J2A2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPIAL4CA0A0B4J2A2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPIAL4CA0A0B4J2A2 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPIAL4CA0A0B4J2A2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PPIAL4CA0A0B4J2A2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPIAL4CA0A0B4J2A2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPIAL4CA0A0B4J2A2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPIAL4CA0A0B4J2A2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPIAL4CA0A0B4J2A2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPIAL4CA0A0B4J2A2 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPIAL4CA0A0B4J2A2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPIAL4CA0A0B4J2A2 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPIAL4CA0A0B4J2A2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPIAL4CA0A0B4J2A2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPIAL4CA0A0B4J2A2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PPIAL4CA0A0B4J2A2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPIAL4CA0A0B4J2A2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPIAL4CA0A0B4J2A2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPIAL4CA0A0B4J2A2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPIAL4CA0A0B4J2A2 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPIAL4CA0A0B4J2A2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPIAL4CA0A0B4J2A2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPIAL4CA0A0B4J2A2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPIAL4CA0A0B4J2A2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPIAL4CA0A0B4J2A2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PPIAL4CA0A0B4J2A2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPIAL4CA0A0B4J2A2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPIAL4CA0A0B4J2A2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PPIAL4CA0A0B4J2A2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPIAL4CA0A0B4J2A2 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPIAL4CA0A0B4J2A2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPIAL4CA0A0B4J2A2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPIAL4CA0A0B4J2A2 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPIAL4CA0A0B4J2A2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPIAL4CA0A0B4J2A2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PPIAL4CA0A0B4J2A2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPIAL4CA0A0B4J2A2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
PPIAL4CA0A0B4J2A2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPIAL4CA0A0B4J2A2 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPIAL4CA0A0B4J2A2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPIAL4CA0A0B4J2A2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPIAL4CA0A0B4J2A2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPIAL4CA0A0B4J2A2 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPIAL4CA0A0B4J2A2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPIAL4CA0A0B4J2A2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PPIAL4CA0A0B4J2A2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPIAL4CA0A0B4J2A2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPIAL4CA0A0B4J2A2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPIAL4CA0A0B4J2A2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPIAL4CA0A0B4J2A2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPIAL4CA0A0B4J2A2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPIAL4CA0A0B4J2A2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPIAL4CA0A0B4J2A2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPIAL4CA0A0B4J2A2 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PPIAL4CA0A0B4J2A2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPIAL4CA0A0B4J2A2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPIAL4CA0A0B4J2A2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPIAL4CA0A0B4J2A2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPIAL4CA0A0B4J2A2 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPIAL4CA0A0B4J2A2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPIAL4CA0A0B4J2A2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPIAL4CA0A0B4J2A2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPIAL4CA0A0B4J2A2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPIAL4CA0A0B4J2A2 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPIAL4CA0A0B4J2A2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPIAL4CA0A0B4J2A2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPIAL4CA0A0B4J2A2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPIAL4CA0A0B4J2A2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPIAL4CA0A0B4J2A2 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPIAL4CA0A0B4J2A2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPIAL4CA0A0B4J2A2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPIAL4CA0A0B4J2A2 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPIAL4CA0A0B4J2A2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPIAL4CA0A0B4J2A2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPIAL4CA0A0B4J2A2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPIAL4CA0A0B4J2A2 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPIAL4CA0A0B4J2A2 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPIAL4CA0A0B4J2A2 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPIAL4CA0A0B4J2A2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPIAL4CA0A0B4J2A2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPIAL4CA0A0B4J2A2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPIAL4CA0A0B4J2A2 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPIAL4CA0A0B4J2A2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPIAL4CA0A0B4J2A2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPIAL4CA0A0B4J2A2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPIAL4CA0A0B4J2A2 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPIAL4CA0A0B4J2A2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPIAL4CA0A0B4J2A2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPIAL4CA0A0B4J2A2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms