Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YY99

TNFSF12-TNFSF13, Protein TNFSF12-TNFSF13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 164.6 ms