Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG2

ZDHHC3, Palmitoyltransferase ZDHHC3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC3Q9NYG2 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ZDHHC3Q9NYG2 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ZDHHC3Q9NYG2 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ZDHHC3Q9NYG2 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZDHHC3Q9NYG2 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZDHHC3Q9NYG2 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ZDHHC3Q9NYG2 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZDHHC3Q9NYG2 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZDHHC3Q9NYG2 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZDHHC3Q9NYG2 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZDHHC3Q9NYG2 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZDHHC3Q9NYG2 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZDHHC3Q9NYG2 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZDHHC3Q9NYG2 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ZDHHC3Q9NYG2 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZDHHC3Q9NYG2 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZDHHC3Q9NYG2 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZDHHC3Q9NYG2 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZDHHC3Q9NYG2 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZDHHC3Q9NYG2 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZDHHC3Q9NYG2 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ZDHHC3Q9NYG2 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZDHHC3Q9NYG2 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZDHHC3Q9NYG2 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZDHHC3Q9NYG2 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZDHHC3Q9NYG2 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ZDHHC3Q9NYG2 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZDHHC3Q9NYG2 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ZDHHC3Q9NYG2 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ZDHHC3Q9NYG2 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZDHHC3Q9NYG2 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZDHHC3Q9NYG2 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZDHHC3Q9NYG2 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ZDHHC3Q9NYG2 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZDHHC3Q9NYG2 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZDHHC3Q9NYG2 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZDHHC3Q9NYG2 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZDHHC3Q9NYG2 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZDHHC3Q9NYG2 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZDHHC3Q9NYG2 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ZDHHC3Q9NYG2 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZDHHC3Q9NYG2 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZDHHC3Q9NYG2 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZDHHC3Q9NYG2 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZDHHC3Q9NYG2 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ZDHHC3Q9NYG2 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ZDHHC3Q9NYG2 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ZDHHC3Q9NYG2 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZDHHC3Q9NYG2 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZDHHC3Q9NYG2 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZDHHC3Q9NYG2 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZDHHC3Q9NYG2 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZDHHC3Q9NYG2 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZDHHC3Q9NYG2 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZDHHC3Q9NYG2 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ZDHHC3Q9NYG2 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZDHHC3Q9NYG2 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZDHHC3Q9NYG2 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZDHHC3Q9NYG2 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZDHHC3Q9NYG2 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZDHHC3Q9NYG2 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZDHHC3Q9NYG2 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZDHHC3Q9NYG2 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZDHHC3Q9NYG2 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZDHHC3Q9NYG2 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ZDHHC3Q9NYG2 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZDHHC3Q9NYG2 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZDHHC3Q9NYG2 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZDHHC3Q9NYG2 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZDHHC3Q9NYG2 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZDHHC3Q9NYG2 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZDHHC3Q9NYG2 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZDHHC3Q9NYG2 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZDHHC3Q9NYG2 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ZDHHC3Q9NYG2 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZDHHC3Q9NYG2 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZDHHC3Q9NYG2 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ZDHHC3Q9NYG2 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZDHHC3Q9NYG2 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZDHHC3Q9NYG2 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZDHHC3Q9NYG2 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZDHHC3Q9NYG2 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ZDHHC3Q9NYG2 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ZDHHC3Q9NYG2 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZDHHC3Q9NYG2 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZDHHC3Q9NYG2 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZDHHC3Q9NYG2 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZDHHC3Q9NYG2 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZDHHC3Q9NYG2 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZDHHC3Q9NYG2 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZDHHC3Q9NYG2 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZDHHC3Q9NYG2 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZDHHC3Q9NYG2 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZDHHC3Q9NYG2 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZDHHC3Q9NYG2 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZDHHC3Q9NYG2 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZDHHC3Q9NYG2 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZDHHC3Q9NYG2 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZDHHC3Q9NYG2 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ZDHHC3Q9NYG2 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms