RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000599630.1

MYDGF-203, Transcript of myeloid derived growth factor, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene MYDGF, Length 713 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYDGF-203ENST00000599630 NISCHQ9Y2I1 1504 aa54.31■■■■■ 6.28
MYDGF-203ENST00000599630 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa48.54■■■■■ 5.36
MYDGF-203ENST00000599630 ABCC9O60706 1549 aa47.7■■■■■ 5.23
MYDGF-203ENST00000599630 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa45.82■■■■■ 4.93
MYDGF-203ENST00000599630 NACADO15069 1562 aa45.67■■■■■ 4.9
MYDGF-203ENST00000599630 DCAF8L2P0C7V8 631 aa45.35■■■■■ 4.85
MYDGF-203ENST00000599630 MYO15BQ96JP2 1530 aa45.33■■■■■ 4.85
MYDGF-203ENST00000599630 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP45.2■■■■■ 4.83
MYDGF-203ENST00000599630 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa44.98■■■■■ 4.79
MYDGF-203ENST00000599630 UNC13AQ9UPW8 1703 aa44.77■■■■■ 4.76
MYDGF-203ENST00000599630 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP44.43■■■■■ 4.7
MYDGF-203ENST00000599630 BICRAQ9NZM4 1560 aa44.41■■■■■ 4.7
MYDGF-203ENST00000599630 SCRIBQ14160 1630 aa44.17■■■■■ 4.66
MYDGF-203ENST00000599630 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa44.02■■■■■ 4.64
MYDGF-203ENST00000599630 DNAJC5BQ9UF47 199 aa44.02■■■■■ 4.64
MYDGF-203ENST00000599630 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP43.29■■■■■ 4.52
MYDGF-203ENST00000599630 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa43.19■■■■■ 4.5
MYDGF-203ENST00000599630 CECR2Q9BXF3 1484 aa42.94■■■■■ 4.46
MYDGF-203ENST00000599630 SMARCA4P51532 1647 aa42.25■■■■■ 4.35
MYDGF-203ENST00000599630 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP42.15■■■■■ 4.34
MYDGF-203ENST00000599630 NCAPD3P42695 1498 aa42.11■■■■■ 4.33
MYDGF-203ENST00000599630 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa42.06■■■■■ 4.32
MYDGF-203ENST00000599630 SMARCA2P51531 1590 aa42.05■■■■■ 4.32
MYDGF-203ENST00000599630 HMGXB3Q12766 1538 aa41.95■■■■■ 4.31
MYDGF-203ENST00000599630 PEG3Q9GZU2 1588 aa41.87■■■■■ 4.29
MYDGF-203ENST00000599630 MROH2BQ7Z745 1585 aa41.82■■■■■ 4.29
MYDGF-203ENST00000599630 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP41.73■■■■■ 4.27
MYDGF-203ENST00000599630 WIZO95785 1651 aa41.36■■■■■ 4.21
MYDGF-203ENST00000599630 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP41.2■■■■■ 4.19
MYDGF-203ENST00000599630 ERCC6Q03468 1493 aa41.19■■■■■ 4.18
MYDGF-203ENST00000599630 NESP48681 1621 aa41.17■■■■■ 4.18
MYDGF-203ENST00000599630 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa41.12■■■■■ 4.17
MYDGF-203ENST00000599630 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP40.95■■■■■ 4.15
MYDGF-203ENST00000599630 CUX2O14529 1486 aa40.93■■■■■ 4.14
MYDGF-203ENST00000599630 CADPSQ9ULU8 1353 aa40.85■■■■■ 4.13
MYDGF-203ENST00000599630 PDS5BQ9NTI5 1447 aa40.8■■■■■ 4.12
MYDGF-203ENST00000599630 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa40.74■■■■■ 4.11
MYDGF-203ENST00000599630 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP40.72■■■■■ 4.11
MYDGF-203ENST00000599630 CFTRP13569 1480 aa40.56■■■■■ 4.08
MYDGF-203ENST00000599630 MRC2Q9UBG0 1479 aa40.42■■■■■ 4.06
MYDGF-203ENST00000599630 CEP164Q9UPV0 1460 aa40.4■■■■■ 4.06
MYDGF-203ENST00000599630 CCDC88BA6NC98 1476 aa40.39■■■■■ 4.06
MYDGF-203ENST00000599630 FANCD2Q9BXW9 1451 aa40.39■■■■■ 4.06
MYDGF-203ENST00000599630 WDR62O43379 1518 aa40.33■■■■■ 4.05
MYDGF-203ENST00000599630 PRDM2Q13029 1718 aa40.3■■■■■ 4.04
MYDGF-203ENST00000599630 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP40.01■■■■□ 3.99
MYDGF-203ENST00000599630 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa39.99■■■■□ 3.99
MYDGF-203ENST00000599630 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP39.77■■■■□ 3.96
MYDGF-203ENST00000599630 ABCC8Q09428 1581 aa39.72■■■■□ 3.95
MYDGF-203ENST00000599630 TOPBP1Q92547 1522 aa39.71■■■■□ 3.95
MYDGF-203ENST00000599630 DNMBPQ6XZF7 1577 aa39.67■■■■□ 3.94
MYDGF-203ENST00000599630 IFT140Q96RY7 1462 aa39.57■■■■□ 3.93
MYDGF-203ENST00000599630 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP39.37■■■■□ 3.89
MYDGF-203ENST00000599630 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP39.35■■■■□ 3.89
MYDGF-203ENST00000599630 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP39.32■■■■□ 3.89
MYDGF-203ENST00000599630 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP39.28■■■■□ 3.88
MYDGF-203ENST00000599630 CUX1P39880 1505 aa39.27■■■■□ 3.88
MYDGF-203ENST00000599630 FGD5Q6ZNL6 1462 aa39.2■■■■□ 3.87
MYDGF-203ENST00000599630 SOGA1O94964 1423 aa39.14■■■■□ 3.86
MYDGF-203ENST00000599630 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa39.13■■■■□ 3.85
MYDGF-203ENST00000599630 WDR97A6NE52 1622 aa39.08■■■■□ 3.85
MYDGF-203ENST00000599630 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP39.08■■■■□ 3.855e-7■■■■□ 20.5
MYDGF-203ENST00000599630 OSCARQ8IYS5 282 aa39.06■■■■□ 3.84
MYDGF-203ENST00000599630 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP38.94■■■■□ 3.82
MYDGF-203ENST00000599630 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa38.89■■■■□ 3.82
MYDGF-203ENST00000599630 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP38.89■■■■□ 3.82
MYDGF-203ENST00000599630 TOP2BQ02880 1626 aa38.88■■■■□ 3.81
MYDGF-203ENST00000599630 CHD1O14646 1710 aa38.84■■■■□ 3.81
MYDGF-203ENST00000599630 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa38.83■■■■□ 3.81
MYDGF-203ENST00000599630 SYNJ1O43426 1573 aa38.82■■■■□ 3.8
MYDGF-203ENST00000599630 GRIN2BQ13224 1484 aa38.78■■■■□ 3.8
MYDGF-203ENST00000599630 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa38.77■■■■□ 3.8
MYDGF-203ENST00000599630 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP38.74■■■■□ 3.79
MYDGF-203ENST00000599630 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa38.73■■■■□ 3.79
MYDGF-203ENST00000599630 GAPVD1Q14C86 1478 aa38.72■■■■□ 3.79
MYDGF-203ENST00000599630 PBRM1Q86U86 1689 aa38.71■■■■□ 3.79
MYDGF-203ENST00000599630 FBLN2P98095 1184 aa38.64■■■■□ 3.78
MYDGF-203ENST00000599630 SYNJ2O15056 1496 aa38.59■■■■□ 3.77
MYDGF-203ENST00000599630 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa38.56■■■■□ 3.76
MYDGF-203ENST00000599630 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa38.56■■■■□ 3.76
MYDGF-203ENST00000599630 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa38.56■■■■□ 3.76
MYDGF-203ENST00000599630 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP38.51■■■■□ 3.76
MYDGF-203ENST00000599630 ARHGEF11O15085 1522 aa38.51■■■■□ 3.76
MYDGF-203ENST00000599630 TRIM41Q8WV44 630 aa38.47■■■■□ 3.75
MYDGF-203ENST00000599630 CLASP1Q7Z460 1538 aa38.43■■■■□ 3.74
MYDGF-203ENST00000599630 ADAMTS12P58397 1594 aa38.39■■■■□ 3.74
MYDGF-203ENST00000599630 ERICH3Q5RHP9 1530 aa38.38■■■■□ 3.73
MYDGF-203ENST00000599630 GRIN2AQ12879 1464 aa38.28■■■■□ 3.72
MYDGF-203ENST00000599630 FHAD1B1AJZ9 1412 aa38.27■■■■□ 3.72
MYDGF-203ENST00000599630 ARAP1Q96P48 1450 aa38.16■■■■□ 3.7
MYDGF-203ENST00000599630 NUP160Q12769 1436 aa38.13■■■■□ 3.7
MYDGF-203ENST00000599630 CEP170Q5SW79 1584 aa38.11■■■■□ 3.69
MYDGF-203ENST00000599630 KIF27Q86VH2 1401 aa38.1■■■■□ 3.69
MYDGF-203ENST00000599630 CYB5RLQ6IPT4 315 aa38.05■■■■□ 3.68
MYDGF-203ENST00000599630 CUL7Q14999 1698 aa37.98■■■■□ 3.67
MYDGF-203ENST00000599630 IGF1RP08069 1367 aa37.93■■■■□ 3.66
MYDGF-203ENST00000599630 SHROOM2Q13796 1616 aa37.92■■■■□ 3.66
MYDGF-203ENST00000599630 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa37.84■■■■□ 3.65
MYDGF-203ENST00000599630 ERCC6L2Q5T890 1561 aa37.8■■■■□ 3.64
MYDGF-203ENST00000599630 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa37.71■■■■□ 3.63
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