Protein–RNA interactions for Protein: Q2MV58

TCTN1, Tectonic-1, humanhuman

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCTN1Q2MV58 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TCTN1Q2MV58 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TCTN1Q2MV58 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TCTN1Q2MV58 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TCTN1Q2MV58 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TCTN1Q2MV58 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TCTN1Q2MV58 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TCTN1Q2MV58 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TCTN1Q2MV58 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TCTN1Q2MV58 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TCTN1Q2MV58 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TCTN1Q2MV58 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TCTN1Q2MV58 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TCTN1Q2MV58 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TCTN1Q2MV58 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TCTN1Q2MV58 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TCTN1Q2MV58 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TCTN1Q2MV58 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TCTN1Q2MV58 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TCTN1Q2MV58 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TCTN1Q2MV58 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TCTN1Q2MV58 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TCTN1Q2MV58 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TCTN1Q2MV58 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TCTN1Q2MV58 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TCTN1Q2MV58 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TCTN1Q2MV58 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TCTN1Q2MV58 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TCTN1Q2MV58 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TCTN1Q2MV58 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TCTN1Q2MV58 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TCTN1Q2MV58 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TCTN1Q2MV58 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TCTN1Q2MV58 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TCTN1Q2MV58 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TCTN1Q2MV58 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TCTN1Q2MV58 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TCTN1Q2MV58 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TCTN1Q2MV58 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TCTN1Q2MV58 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TCTN1Q2MV58 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TCTN1Q2MV58 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TCTN1Q2MV58 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TCTN1Q2MV58 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TCTN1Q2MV58 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TCTN1Q2MV58 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TCTN1Q2MV58 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TCTN1Q2MV58 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TCTN1Q2MV58 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TCTN1Q2MV58 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TCTN1Q2MV58 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TCTN1Q2MV58 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TCTN1Q2MV58 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TCTN1Q2MV58 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TCTN1Q2MV58 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TCTN1Q2MV58 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TCTN1Q2MV58 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TCTN1Q2MV58 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TCTN1Q2MV58 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TCTN1Q2MV58 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TCTN1Q2MV58 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TCTN1Q2MV58 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TCTN1Q2MV58 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TCTN1Q2MV58 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TCTN1Q2MV58 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TCTN1Q2MV58 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TCTN1Q2MV58 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TCTN1Q2MV58 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TCTN1Q2MV58 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TCTN1Q2MV58 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TCTN1Q2MV58 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TCTN1Q2MV58 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TCTN1Q2MV58 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TCTN1Q2MV58 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TCTN1Q2MV58 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TCTN1Q2MV58 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TCTN1Q2MV58 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TCTN1Q2MV58 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TCTN1Q2MV58 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TCTN1Q2MV58 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TCTN1Q2MV58 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TCTN1Q2MV58 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TCTN1Q2MV58 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TCTN1Q2MV58 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TCTN1Q2MV58 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TCTN1Q2MV58 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TCTN1Q2MV58 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TCTN1Q2MV58 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TCTN1Q2MV58 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TCTN1Q2MV58 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TCTN1Q2MV58 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TCTN1Q2MV58 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TCTN1Q2MV58 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TCTN1Q2MV58 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TCTN1Q2MV58 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TCTN1Q2MV58 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TCTN1Q2MV58 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TCTN1Q2MV58 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TCTN1Q2MV58 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TCTN1Q2MV58 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms