RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368448.5

PKIB-204, Transcript of cAMP-dependent protein kinase inhibitor beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene PKIB, Length 1,561 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKIB-204ENST00000368448 NISCHQ9Y2I1 1504 aa52.66■■■■■ 6.02
PKIB-204ENST00000368448 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa46.36■■■■■ 5.01
PKIB-204ENST00000368448 ABCC9O60706 1549 aa44.68■■■■■ 4.74
PKIB-204ENST00000368448 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP44.04■■■■■ 4.64
PKIB-204ENST00000368448 DCAF8L2P0C7V8 631 aa43.72■■■■■ 4.59
PKIB-204ENST00000368448 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa43.55■■■■■ 4.56
PKIB-204ENST00000368448 NACADO15069 1562 aa43.42■■■■■ 4.54
PKIB-204ENST00000368448 MYO15BQ96JP2 1530 aa43.41■■■■■ 4.54
PKIB-204ENST00000368448 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa43.25■■■■■ 4.51
PKIB-204ENST00000368448 SCRIBQ14160 1630 aa42.46■■■■■ 4.39
PKIB-204ENST00000368448 UNC13AQ9UPW8 1703 aa42.34■■■■■ 4.37
PKIB-204ENST00000368448 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa42.2■■■■■ 4.35
PKIB-204ENST00000368448 BICRAQ9NZM4 1560 aa41.99■■■■■ 4.31
PKIB-204ENST00000368448 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP41.94■■■■■ 4.3
PKIB-204ENST00000368448 CECR2Q9BXF3 1484 aa40.99■■■■■ 4.15
PKIB-204ENST00000368448 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP40.79■■■■■ 4.12
PKIB-204ENST00000368448 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP40.72■■■■■ 4.11
PKIB-204ENST00000368448 SMARCA4P51532 1647 aa40.66■■■■■ 4.1
PKIB-204ENST00000368448 MROH2BQ7Z745 1585 aa40.64■■■■■ 4.1
PKIB-204ENST00000368448 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP40.47■■■■■ 4.07
PKIB-204ENST00000368448 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa40.42■■■■■ 4.06
PKIB-204ENST00000368448 DNAJC5BQ9UF47 199 aa40.33■■■■■ 4.05
PKIB-204ENST00000368448 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa40.26■■■■■ 4.04
PKIB-204ENST00000368448 WIZO95785 1651 aa40.24■■■■■ 4.03
PKIB-204ENST00000368448 PEG3Q9GZU2 1588 aa40.24■■■■■ 4.03
PKIB-204ENST00000368448 SMARCA2P51531 1590 aa40.19■■■■■ 4.02
PKIB-204ENST00000368448 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP40.13■■■■■ 4.01
PKIB-204ENST00000368448 NCAPD3P42695 1498 aa40.08■■■■■ 4.01
PKIB-204ENST00000368448 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP39.95■■■■□ 3.99
PKIB-204ENST00000368448 HMGXB3Q12766 1538 aa39.93■■■■□ 3.98
PKIB-204ENST00000368448 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP39.81■■■■□ 3.96
PKIB-204ENST00000368448 CCDC88BA6NC98 1476 aa39.38■■■■□ 3.9
PKIB-204ENST00000368448 CADPSQ9ULU8 1353 aa38.97■■■■□ 3.83
PKIB-204ENST00000368448 NESP48681 1621 aa38.94■■■■□ 3.82
PKIB-204ENST00000368448 CFTRP13569 1480 aa38.91■■■■□ 3.82
PKIB-204ENST00000368448 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa38.86■■■■□ 3.81
PKIB-204ENST00000368448 PRDM2Q13029 1718 aa38.64■■■■□ 3.78
PKIB-204ENST00000368448 PDS5BQ9NTI5 1447 aa38.58■■■■□ 3.77
PKIB-204ENST00000368448 FANCD2Q9BXW9 1451 aa38.53■■■■□ 3.76
PKIB-204ENST00000368448 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa38.45■■■■□ 3.74
PKIB-204ENST00000368448 ERCC6Q03468 1493 aa38.39■■■■□ 3.74
PKIB-204ENST00000368448 CEP164Q9UPV0 1460 aa38.37■■■■□ 3.73
PKIB-204ENST00000368448 ABCC8Q09428 1581 aa38.23■■■■□ 3.71
PKIB-204ENST00000368448 MRC2Q9UBG0 1479 aa38.15■■■■□ 3.7
PKIB-204ENST00000368448 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP38.12■■■■□ 3.69
PKIB-204ENST00000368448 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP38.11■■■■□ 3.69
PKIB-204ENST00000368448 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP38.09■■■■□ 3.69
PKIB-204ENST00000368448 CUX1P39880 1505 aa38.06■■■■□ 3.68
PKIB-204ENST00000368448 TOPBP1Q92547 1522 aa38.02■■■■□ 3.68
PKIB-204ENST00000368448 DNMBPQ6XZF7 1577 aa38.01■■■■□ 3.68
PKIB-204ENST00000368448 WDR62O43379 1518 aa37.99■■■■□ 3.67
PKIB-204ENST00000368448 SYNJ1O43426 1573 aa37.99■■■■□ 3.67
PKIB-204ENST00000368448 CHIC1Q5VXU3 224 aa37.95■■■■□ 3.67
PKIB-204ENST00000368448 TOP2BQ02880 1626 aa37.91■■■■□ 3.66
PKIB-204ENST00000368448 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa37.9■■■■□ 3.66
PKIB-204ENST00000368448 TRIM41Q8WV44 630 aa37.81■■■■□ 3.64
PKIB-204ENST00000368448 FGD5Q6ZNL6 1462 aa37.79■■■■□ 3.64
PKIB-204ENST00000368448 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP37.75■■■■□ 3.63
PKIB-204ENST00000368448 CUX2O14529 1486 aa37.68■■■■□ 3.62
PKIB-204ENST00000368448 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa37.62■■■■□ 3.61
PKIB-204ENST00000368448 SOGA1O94964 1423 aa37.61■■■■□ 3.61
PKIB-204ENST00000368448 IFT140Q96RY7 1462 aa37.54■■■■□ 3.6
PKIB-204ENST00000368448 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP37.53■■■■□ 3.6
PKIB-204ENST00000368448 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa37.44■■■■□ 3.58
PKIB-204ENST00000368448 WDR97A6NE52 1622 aa37.4■■■■□ 3.58
PKIB-204ENST00000368448 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP37.36■■■■□ 3.57
PKIB-204ENST00000368448 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP37.34■■■■□ 3.57
PKIB-204ENST00000368448 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP37.26■■■■□ 3.55
PKIB-204ENST00000368448 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa37.25■■■■□ 3.55
PKIB-204ENST00000368448 KIF27Q86VH2 1401 aa37.22■■■■□ 3.55
PKIB-204ENST00000368448 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa37.21■■■■□ 3.55
PKIB-204ENST00000368448 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP37.2■■■■□ 3.55
PKIB-204ENST00000368448 GAPVD1Q14C86 1478 aa37.18■■■■□ 3.54
PKIB-204ENST00000368448 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP37.08■■■■□ 3.53
PKIB-204ENST00000368448 GRIN2BQ13224 1484 aa37.05■■■■□ 3.52
PKIB-204ENST00000368448 EEA1Q15075 1411 aa37.04■■■■□ 3.52
PKIB-204ENST00000368448 PBRM1Q86U86 1689 aa37.03■■■■□ 3.52
PKIB-204ENST00000368448 IGF1RP08069 1367 aa37.02■■■■□ 3.52
PKIB-204ENST00000368448 ERICH3Q5RHP9 1530 aa36.98■■■■□ 3.51
PKIB-204ENST00000368448 CSRNP3Q8WYN3 585 aa36.95■■■■□ 3.51
PKIB-204ENST00000368448 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa36.91■■■■□ 3.5
PKIB-204ENST00000368448 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP36.84■■■■□ 3.49
PKIB-204ENST00000368448 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa36.8■■■■□ 3.48
PKIB-204ENST00000368448 ADAMTS12P58397 1594 aa36.8■■■■□ 3.48
PKIB-204ENST00000368448 CUL7Q14999 1698 aa36.79■■■■□ 3.48
PKIB-204ENST00000368448 FHAD1B1AJZ9 1412 aa36.77■■■■□ 3.48
PKIB-204ENST00000368448 PRXQ9BXM0 1461 aa36.76■■■■□ 3.47
PKIB-204ENST00000368448 SYNJ2O15056 1496 aa36.7■■■■□ 3.47
PKIB-204ENST00000368448 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa36.65■■■■□ 3.46
PKIB-204ENST00000368448 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP36.65■■■■□ 3.46
PKIB-204ENST00000368448 FBLN2P98095 1184 aa36.64■■■■□ 3.46
PKIB-204ENST00000368448 KIF21BO75037 1637 aa36.62■■■■□ 3.45
PKIB-204ENST00000368448 GRIN2AQ12879 1464 aa36.58■■■■□ 3.45
PKIB-204ENST00000368448 CHD1O14646 1710 aa36.58■■■■□ 3.45
PKIB-204ENST00000368448 EHMT2Q96KQ7 1210 aa36.56■■■■□ 3.44
PKIB-204ENST00000368448 GOLGA3Q08378 1498 aa36.49■■■■□ 3.43
PKIB-204ENST00000368448 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa36.44■■■■□ 3.42
PKIB-204ENST00000368448 NUP160Q12769 1436 aa36.39■■■■□ 3.42
PKIB-204ENST00000368448 CEP170Q5SW79 1584 aa36.38■■■■□ 3.42
PKIB-204ENST00000368448 UBTFP17480 764 aaKnown RBP36.35■■■■□ 3.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.5 ms