RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264775.9

PLPP1-201, Transcript of phospholipid phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PLPP1, Length 1,550 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLPP1-201ENST00000264775 NISCHQ9Y2I1 1504 aa52.73■■■■■ 6.03
PLPP1-201ENST00000264775 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa46.53■■■■■ 5.04
PLPP1-201ENST00000264775 ABCC9O60706 1549 aa45.22■■■■■ 4.83
PLPP1-201ENST00000264775 DCAF8L2P0C7V8 631 aa44.1■■■■■ 4.65
PLPP1-201ENST00000264775 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP43.98■■■■■ 4.63
PLPP1-201ENST00000264775 NACADO15069 1562 aa43.7■■■■■ 4.59
PLPP1-201ENST00000264775 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa43.63■■■■■ 4.57
PLPP1-201ENST00000264775 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa43.58■■■■■ 4.57
PLPP1-201ENST00000264775 MYO15BQ96JP2 1530 aa43.57■■■■■ 4.56
PLPP1-201ENST00000264775 UNC13AQ9UPW8 1703 aa42.61■■■■■ 4.41
PLPP1-201ENST00000264775 SCRIBQ14160 1630 aa42.6■■■■■ 4.41
PLPP1-201ENST00000264775 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP42.45■■■■■ 4.39
PLPP1-201ENST00000264775 BICRAQ9NZM4 1560 aa42.3■■■■■ 4.36
PLPP1-201ENST00000264775 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa42.1■■■■■ 4.33
PLPP1-201ENST00000264775 DNAJC5BQ9UF47 199 aa41.16■■■■■ 4.18
PLPP1-201ENST00000264775 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP41.15■■■■■ 4.18
PLPP1-201ENST00000264775 CECR2Q9BXF3 1484 aa41.08■■■■■ 4.17
PLPP1-201ENST00000264775 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa40.87■■■■■ 4.13
PLPP1-201ENST00000264775 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP40.8■■■■■ 4.12
PLPP1-201ENST00000264775 SMARCA4P51532 1647 aa40.76■■■■■ 4.12
PLPP1-201ENST00000264775 MROH2BQ7Z745 1585 aa40.67■■■■■ 4.1
PLPP1-201ENST00000264775 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa40.47■■■■■ 4.07
PLPP1-201ENST00000264775 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP40.41■■■■■ 4.06
PLPP1-201ENST00000264775 SMARCA2P51531 1590 aa40.4■■■■■ 4.06
PLPP1-201ENST00000264775 NCAPD3P42695 1498 aa40.37■■■■■ 4.05
PLPP1-201ENST00000264775 PEG3Q9GZU2 1588 aa40.33■■■■■ 4.05
PLPP1-201ENST00000264775 WIZO95785 1651 aa40.24■■■■■ 4.03
PLPP1-201ENST00000264775 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP40.15■■■■■ 4.02
PLPP1-201ENST00000264775 HMGXB3Q12766 1538 aa40.14■■■■■ 4.02
PLPP1-201ENST00000264775 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP39.93■■■■□ 3.98
PLPP1-201ENST00000264775 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP39.8■■■■□ 3.96
PLPP1-201ENST00000264775 CCDC88BA6NC98 1476 aa39.42■■■■□ 3.9
PLPP1-201ENST00000264775 NESP48681 1621 aa39.28■■■■□ 3.88
PLPP1-201ENST00000264775 CADPSQ9ULU8 1353 aa39.26■■■■□ 3.88
PLPP1-201ENST00000264775 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa39.17■■■■□ 3.86
PLPP1-201ENST00000264775 CFTRP13569 1480 aa39.1■■■■□ 3.85
PLPP1-201ENST00000264775 PDS5BQ9NTI5 1447 aa38.96■■■■□ 3.83
PLPP1-201ENST00000264775 ERCC6Q03468 1493 aa38.92■■■■□ 3.82
PLPP1-201ENST00000264775 FANCD2Q9BXW9 1451 aa38.77■■■■□ 3.8
PLPP1-201ENST00000264775 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa38.74■■■■□ 3.79
PLPP1-201ENST00000264775 PRDM2Q13029 1718 aa38.7■■■■□ 3.79
PLPP1-201ENST00000264775 CEP164Q9UPV0 1460 aa38.65■■■■□ 3.78
PLPP1-201ENST00000264775 MRC2Q9UBG0 1479 aa38.49■■■■□ 3.75
PLPP1-201ENST00000264775 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP38.45■■■■□ 3.75
PLPP1-201ENST00000264775 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP38.35■■■■□ 3.73
PLPP1-201ENST00000264775 WDR62O43379 1518 aa38.31■■■■□ 3.72
PLPP1-201ENST00000264775 CUX2O14529 1486 aa38.26■■■■□ 3.71
PLPP1-201ENST00000264775 ABCC8Q09428 1581 aa38.22■■■■□ 3.71
PLPP1-201ENST00000264775 TOPBP1Q92547 1522 aa38.2■■■■□ 3.71
PLPP1-201ENST00000264775 DNMBPQ6XZF7 1577 aa38.16■■■■□ 3.7
PLPP1-201ENST00000264775 CUX1P39880 1505 aa38.1■■■■□ 3.69
PLPP1-201ENST00000264775 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP38.08■■■■□ 3.69
PLPP1-201ENST00000264775 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP37.91■■■■□ 3.66
PLPP1-201ENST00000264775 SYNJ1O43426 1573 aa37.91■■■■□ 3.66
PLPP1-201ENST00000264775 FGD5Q6ZNL6 1462 aa37.9■■■■□ 3.66
PLPP1-201ENST00000264775 TOP2BQ02880 1626 aa37.87■■■■□ 3.65
PLPP1-201ENST00000264775 SOGA1O94964 1423 aa37.84■■■■□ 3.65
PLPP1-201ENST00000264775 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa37.84■■■■□ 3.65
PLPP1-201ENST00000264775 IFT140Q96RY7 1462 aa37.82■■■■□ 3.65
PLPP1-201ENST00000264775 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa37.8■■■■□ 3.64
PLPP1-201ENST00000264775 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP37.71■■■■□ 3.63
PLPP1-201ENST00000264775 TRIM41Q8WV44 630 aa37.67■■■■□ 3.62
PLPP1-201ENST00000264775 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP37.66■■■■□ 3.62
PLPP1-201ENST00000264775 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP37.59■■■■□ 3.61
PLPP1-201ENST00000264775 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP37.56■■■■□ 3.6
PLPP1-201ENST00000264775 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa37.54■■■■□ 3.6
PLPP1-201ENST00000264775 CHIC1Q5VXU3 224 aa37.53■■■■□ 3.6
PLPP1-201ENST00000264775 WDR97A6NE52 1622 aa37.45■■■■□ 3.59
PLPP1-201ENST00000264775 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP37.44■■■■□ 3.58
PLPP1-201ENST00000264775 GAPVD1Q14C86 1478 aa37.37■■■■□ 3.57
PLPP1-201ENST00000264775 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa37.29■■■■□ 3.56
PLPP1-201ENST00000264775 GRIN2BQ13224 1484 aa37.27■■■■□ 3.56
PLPP1-201ENST00000264775 KIF27Q86VH2 1401 aa37.25■■■■□ 3.55
PLPP1-201ENST00000264775 PBRM1Q86U86 1689 aa37.15■■■■□ 3.54
PLPP1-201ENST00000264775 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa37.14■■■■□ 3.54
PLPP1-201ENST00000264775 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa37.12■■■■□ 3.53
PLPP1-201ENST00000264775 FBLN2P98095 1184 aa37.1■■■■□ 3.53
PLPP1-201ENST00000264775 IGF1RP08069 1367 aa37.09■■■■□ 3.53
PLPP1-201ENST00000264775 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP37.09■■■■□ 3.53
PLPP1-201ENST00000264775 ERICH3Q5RHP9 1530 aa37.08■■■■□ 3.53
PLPP1-201ENST00000264775 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP37.04■■■■□ 3.52
PLPP1-201ENST00000264775 SYNJ2O15056 1496 aa36.96■■■■□ 3.51
PLPP1-201ENST00000264775 FHAD1B1AJZ9 1412 aa36.94■■■■□ 3.5
PLPP1-201ENST00000264775 OSCARQ8IYS5 282 aa36.93■■■■□ 3.5
PLPP1-201ENST00000264775 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP36.91■■■■□ 3.5
PLPP1-201ENST00000264775 ADAMTS12P58397 1594 aa36.89■■■■□ 3.5
PLPP1-201ENST00000264775 CHD1O14646 1710 aa36.88■■■■□ 3.49
PLPP1-201ENST00000264775 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa36.87■■■■□ 3.49
PLPP1-201ENST00000264775 CSRNP3Q8WYN3 585 aa36.86■■■■□ 3.49
PLPP1-201ENST00000264775 EEA1Q15075 1411 aa36.83■■■■□ 3.49
PLPP1-201ENST00000264775 CUL7Q14999 1698 aa36.81■■■■□ 3.48
PLPP1-201ENST00000264775 GRIN2AQ12879 1464 aa36.78■■■■□ 3.48
PLPP1-201ENST00000264775 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa36.66■■■■□ 3.46
PLPP1-201ENST00000264775 PRXQ9BXM0 1461 aa36.64■■■■□ 3.46
PLPP1-201ENST00000264775 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa36.64■■■■□ 3.46
PLPP1-201ENST00000264775 NUP160Q12769 1436 aa36.58■■■■□ 3.45
PLPP1-201ENST00000264775 CEP170Q5SW79 1584 aa36.56■■■■□ 3.44
PLPP1-201ENST00000264775 CLASP1Q7Z460 1538 aa36.48■■■■□ 3.43
PLPP1-201ENST00000264775 EHMT2Q96KQ7 1210 aa36.44■■■■□ 3.42
PLPP1-201ENST00000264775 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa36.4■■■■□ 3.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.5 ms