RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000457661.5

ITGA9-AS1-210, ITGA9 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene ITGA9-AS1, Length 738 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9-AS1-210ENST00000457661 NISCHQ9Y2I1 1504 aa52.68■■■■■ 6.02
ITGA9-AS1-210ENST00000457661 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa46.65■■■■■ 5.06
ITGA9-AS1-210ENST00000457661 ABCC9O60706 1549 aa45.77■■■■■ 4.92
ITGA9-AS1-210ENST00000457661 DCAF8L2P0C7V8 631 aa44.07■■■■■ 4.65
ITGA9-AS1-210ENST00000457661 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa43.95■■■■■ 4.63
ITGA9-AS1-210ENST00000457661 NACADO15069 1562 aa43.93■■■■■ 4.62
ITGA9-AS1-210ENST00000457661 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP43.88■■■■■ 4.61
ITGA9-AS1-210ENST00000457661 MYO15BQ96JP2 1530 aa43.71■■■■■ 4.59
ITGA9-AS1-210ENST00000457661 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa43.55■■■■■ 4.56
ITGA9-AS1-210ENST00000457661 UNC13AQ9UPW8 1703 aa42.94■■■■■ 4.46
ITGA9-AS1-210ENST00000457661 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP42.89■■■■■ 4.46
ITGA9-AS1-210ENST00000457661 BICRAQ9NZM4 1560 aa42.72■■■■■ 4.43
ITGA9-AS1-210ENST00000457661 SCRIBQ14160 1630 aa42.66■■■■■ 4.42
ITGA9-AS1-210ENST00000457661 DNAJC5BQ9UF47 199 aa42.17■■■■■ 4.34
ITGA9-AS1-210ENST00000457661 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa42.14■■■■■ 4.34
ITGA9-AS1-210ENST00000457661 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP41.54■■■■■ 4.24
ITGA9-AS1-210ENST00000457661 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa41.36■■■■■ 4.21
ITGA9-AS1-210ENST00000457661 CECR2Q9BXF3 1484 aa41.12■■■■■ 4.17
ITGA9-AS1-210ENST00000457661 SMARCA4P51532 1647 aa40.81■■■■■ 4.12
ITGA9-AS1-210ENST00000457661 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP40.76■■■■■ 4.12
ITGA9-AS1-210ENST00000457661 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa40.66■■■■■ 4.1
ITGA9-AS1-210ENST00000457661 MROH2BQ7Z745 1585 aa40.64■■■■■ 4.1
ITGA9-AS1-210ENST00000457661 NCAPD3P42695 1498 aa40.63■■■■■ 4.09
ITGA9-AS1-210ENST00000457661 SMARCA2P51531 1590 aa40.5■■■■■ 4.07
ITGA9-AS1-210ENST00000457661 PEG3Q9GZU2 1588 aa40.43■■■■■ 4.06
ITGA9-AS1-210ENST00000457661 HMGXB3Q12766 1538 aa40.33■■■■■ 4.05
ITGA9-AS1-210ENST00000457661 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP40.25■■■■■ 4.03
ITGA9-AS1-210ENST00000457661 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP40.21■■■■■ 4.03
ITGA9-AS1-210ENST00000457661 WIZO95785 1651 aa40.15■■■■■ 4.02
ITGA9-AS1-210ENST00000457661 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP39.7■■■■□ 3.95
ITGA9-AS1-210ENST00000457661 NESP48681 1621 aa39.66■■■■□ 3.94
ITGA9-AS1-210ENST00000457661 CADPSQ9ULU8 1353 aa39.46■■■■□ 3.91
ITGA9-AS1-210ENST00000457661 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa39.45■■■■□ 3.91
ITGA9-AS1-210ENST00000457661 ERCC6Q03468 1493 aa39.37■■■■□ 3.89
ITGA9-AS1-210ENST00000457661 CCDC88BA6NC98 1476 aa39.32■■■■□ 3.89
ITGA9-AS1-210ENST00000457661 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP39.25■■■■□ 3.87
ITGA9-AS1-210ENST00000457661 PDS5BQ9NTI5 1447 aa39.23■■■■□ 3.87
ITGA9-AS1-210ENST00000457661 CFTRP13569 1480 aa39.22■■■■□ 3.87
ITGA9-AS1-210ENST00000457661 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa39.06■■■■□ 3.84
ITGA9-AS1-210ENST00000457661 FANCD2Q9BXW9 1451 aa38.96■■■■□ 3.83
ITGA9-AS1-210ENST00000457661 CUX2O14529 1486 aa38.95■■■■□ 3.83
ITGA9-AS1-210ENST00000457661 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP38.95■■■■□ 3.83
ITGA9-AS1-210ENST00000457661 CEP164Q9UPV0 1460 aa38.86■■■■□ 3.81
ITGA9-AS1-210ENST00000457661 MRC2Q9UBG0 1479 aa38.81■■■■□ 3.8
ITGA9-AS1-210ENST00000457661 PRDM2Q13029 1718 aa38.71■■■■□ 3.79
ITGA9-AS1-210ENST00000457661 WDR62O43379 1518 aa38.68■■■■□ 3.78
ITGA9-AS1-210ENST00000457661 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP38.59■■■■□ 3.77
ITGA9-AS1-210ENST00000457661 TOPBP1Q92547 1522 aa38.34■■■■□ 3.73
ITGA9-AS1-210ENST00000457661 ABCC8Q09428 1581 aa38.28■■■■□ 3.72
ITGA9-AS1-210ENST00000457661 DNMBPQ6XZF7 1577 aa38.25■■■■□ 3.71
ITGA9-AS1-210ENST00000457661 CUX1P39880 1505 aa38.09■■■■□ 3.69
ITGA9-AS1-210ENST00000457661 IFT140Q96RY7 1462 aa38.07■■■■□ 3.68
ITGA9-AS1-210ENST00000457661 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP38.03■■■■□ 3.68
ITGA9-AS1-210ENST00000457661 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP37.97■■■■□ 3.67
ITGA9-AS1-210ENST00000457661 FGD5Q6ZNL6 1462 aa37.93■■■■□ 3.66
ITGA9-AS1-210ENST00000457661 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa37.92■■■■□ 3.66
ITGA9-AS1-210ENST00000457661 SOGA1O94964 1423 aa37.91■■■■□ 3.66
ITGA9-AS1-210ENST00000457661 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP37.9■■■■□ 3.66
ITGA9-AS1-210ENST00000457661 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP37.85■■■■□ 3.65
ITGA9-AS1-210ENST00000457661 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa37.84■■■■□ 3.65
ITGA9-AS1-210ENST00000457661 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP37.77■■■■□ 3.64
ITGA9-AS1-210ENST00000457661 SYNJ1O43426 1573 aa37.75■■■■□ 3.63
ITGA9-AS1-210ENST00000457661 TOP2BQ02880 1626 aa37.72■■■■□ 3.63
ITGA9-AS1-210ENST00000457661 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP37.71■■■■□ 3.63
ITGA9-AS1-210ENST00000457661 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP37.7■■■■□ 3.63
ITGA9-AS1-210ENST00000457661 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa37.69■■■■□ 3.62
ITGA9-AS1-210ENST00000457661 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa37.57■■■■□ 3.61
ITGA9-AS1-210ENST00000457661 WDR97A6NE52 1622 aa37.54■■■■□ 3.6
ITGA9-AS1-210ENST00000457661 OSCARQ8IYS5 282 aa37.45■■■■□ 3.59
ITGA9-AS1-210ENST00000457661 GAPVD1Q14C86 1478 aa37.43■■■■□ 3.58
ITGA9-AS1-210ENST00000457661 GRIN2BQ13224 1484 aa37.4■■■■□ 3.58
ITGA9-AS1-210ENST00000457661 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa37.37■■■■□ 3.57
ITGA9-AS1-210ENST00000457661 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa37.36■■■■□ 3.57
ITGA9-AS1-210ENST00000457661 FBLN2P98095 1184 aa37.28■■■■□ 3.56
ITGA9-AS1-210ENST00000457661 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP37.27■■■■□ 3.56
ITGA9-AS1-210ENST00000457661 PBRM1Q86U86 1689 aa37.23■■■■□ 3.55
ITGA9-AS1-210ENST00000457661 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP37.19■■■■□ 3.54
ITGA9-AS1-210ENST00000457661 CHD1O14646 1710 aa37.19■■■■□ 3.54
ITGA9-AS1-210ENST00000457661 SYNJ2O15056 1496 aa37.15■■■■□ 3.54
ITGA9-AS1-210ENST00000457661 ERICH3Q5RHP9 1530 aa37.09■■■■□ 3.53
ITGA9-AS1-210ENST00000457661 KIF27Q86VH2 1401 aa37.03■■■■□ 3.52
ITGA9-AS1-210ENST00000457661 TRIM41Q8WV44 630 aa37.03■■■■□ 3.52
ITGA9-AS1-210ENST00000457661 IGF1RP08069 1367 aa37■■■■□ 3.51
ITGA9-AS1-210ENST00000457661 FHAD1B1AJZ9 1412 aa37■■■■□ 3.51
ITGA9-AS1-210ENST00000457661 ADAMTS12P58397 1594 aa37■■■■□ 3.51
ITGA9-AS1-210ENST00000457661 GRIN2AQ12879 1464 aa36.92■■■■□ 3.5
ITGA9-AS1-210ENST00000457661 CLASP1Q7Z460 1538 aa36.87■■■■□ 3.49
ITGA9-AS1-210ENST00000457661 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa36.85■■■■□ 3.49
ITGA9-AS1-210ENST00000457661 NUP160Q12769 1436 aa36.79■■■■□ 3.48
ITGA9-AS1-210ENST00000457661 ARHGEF11O15085 1522 aa36.77■■■■□ 3.48
ITGA9-AS1-210ENST00000457661 CEP170Q5SW79 1584 aa36.75■■■■□ 3.47
ITGA9-AS1-210ENST00000457661 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa36.75■■■■□ 3.47
ITGA9-AS1-210ENST00000457661 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa36.75■■■■□ 3.47
ITGA9-AS1-210ENST00000457661 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa36.75■■■■□ 3.47
ITGA9-AS1-210ENST00000457661 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa36.73■■■■□ 3.47
ITGA9-AS1-210ENST00000457661 CHIC1Q5VXU3 224 aa36.7■■■■□ 3.47
ITGA9-AS1-210ENST00000457661 CUL7Q14999 1698 aa36.68■■■■□ 3.46
ITGA9-AS1-210ENST00000457661 CYB5RLQ6IPT4 315 aa36.52■■■■□ 3.44
ITGA9-AS1-210ENST00000457661 ARAP1Q96P48 1450 aa36.51■■■■□ 3.44
ITGA9-AS1-210ENST00000457661 JPH4Q96JJ6 628 aa36.49■■■■□ 3.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.9 ms