Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ARL2-SNX15V9GYD0 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARL2-SNX15V9GYD0 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARL2-SNX15V9GYD0 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARL2-SNX15V9GYD0 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARL2-SNX15V9GYD0 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ARL2-SNX15V9GYD0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ARL2-SNX15V9GYD0 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARL2-SNX15V9GYD0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARL2-SNX15V9GYD0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARL2-SNX15V9GYD0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARL2-SNX15V9GYD0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARL2-SNX15V9GYD0 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARL2-SNX15V9GYD0 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARL2-SNX15V9GYD0 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARL2-SNX15V9GYD0 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ARL2-SNX15V9GYD0 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARL2-SNX15V9GYD0 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARL2-SNX15V9GYD0 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARL2-SNX15V9GYD0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARL2-SNX15V9GYD0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARL2-SNX15V9GYD0 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARL2-SNX15V9GYD0 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARL2-SNX15V9GYD0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARL2-SNX15V9GYD0 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARL2-SNX15V9GYD0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARL2-SNX15V9GYD0 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARL2-SNX15V9GYD0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARL2-SNX15V9GYD0 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARL2-SNX15V9GYD0 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARL2-SNX15V9GYD0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARL2-SNX15V9GYD0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARL2-SNX15V9GYD0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARL2-SNX15V9GYD0 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ARL2-SNX15V9GYD0 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARL2-SNX15V9GYD0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARL2-SNX15V9GYD0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARL2-SNX15V9GYD0 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARL2-SNX15V9GYD0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARL2-SNX15V9GYD0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ARL2-SNX15V9GYD0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARL2-SNX15V9GYD0 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARL2-SNX15V9GYD0 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARL2-SNX15V9GYD0 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARL2-SNX15V9GYD0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARL2-SNX15V9GYD0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARL2-SNX15V9GYD0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARL2-SNX15V9GYD0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARL2-SNX15V9GYD0 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ARL2-SNX15V9GYD0 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARL2-SNX15V9GYD0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARL2-SNX15V9GYD0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARL2-SNX15V9GYD0 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARL2-SNX15V9GYD0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARL2-SNX15V9GYD0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARL2-SNX15V9GYD0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARL2-SNX15V9GYD0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARL2-SNX15V9GYD0 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARL2-SNX15V9GYD0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARL2-SNX15V9GYD0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARL2-SNX15V9GYD0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ARL2-SNX15V9GYD0 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ARL2-SNX15V9GYD0 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ARL2-SNX15V9GYD0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ARL2-SNX15V9GYD0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ARL2-SNX15V9GYD0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ARL2-SNX15V9GYD0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARL2-SNX15V9GYD0 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARL2-SNX15V9GYD0 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARL2-SNX15V9GYD0 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARL2-SNX15V9GYD0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ARL2-SNX15V9GYD0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ARL2-SNX15V9GYD0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ARL2-SNX15V9GYD0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ARL2-SNX15V9GYD0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ARL2-SNX15V9GYD0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARL2-SNX15V9GYD0 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARL2-SNX15V9GYD0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ARL2-SNX15V9GYD0 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ARL2-SNX15V9GYD0 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ARL2-SNX15V9GYD0 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ARL2-SNX15V9GYD0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ARL2-SNX15V9GYD0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ARL2-SNX15V9GYD0 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ARL2-SNX15V9GYD0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ARL2-SNX15V9GYD0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ARL2-SNX15V9GYD0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARL2-SNX15V9GYD0 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARL2-SNX15V9GYD0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARL2-SNX15V9GYD0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARL2-SNX15V9GYD0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ARL2-SNX15V9GYD0 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ARL2-SNX15V9GYD0 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ARL2-SNX15V9GYD0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ARL2-SNX15V9GYD0 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms