Protein–RNA interactions for Protein: U3KQ87

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQ87 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
U3KQ87 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
U3KQ87 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
U3KQ87 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
U3KQ87 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
U3KQ87 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
U3KQ87 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
U3KQ87 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
U3KQ87 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
U3KQ87 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
U3KQ87 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
U3KQ87 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
U3KQ87 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
U3KQ87 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
U3KQ87 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
U3KQ87 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
U3KQ87 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
U3KQ87 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
U3KQ87 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
U3KQ87 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
U3KQ87 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
U3KQ87 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
U3KQ87 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
U3KQ87 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
U3KQ87 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
U3KQ87 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
U3KQ87 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
U3KQ87 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
U3KQ87 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
U3KQ87 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
U3KQ87 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
U3KQ87 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
U3KQ87 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
U3KQ87 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
U3KQ87 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
U3KQ87 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
U3KQ87 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
U3KQ87 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
U3KQ87 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
U3KQ87 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
U3KQ87 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
U3KQ87 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
U3KQ87 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
U3KQ87 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
U3KQ87 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
U3KQ87 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
U3KQ87 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
U3KQ87 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
U3KQ87 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
U3KQ87 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
U3KQ87 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
U3KQ87 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
U3KQ87 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
U3KQ87 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
U3KQ87 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
U3KQ87 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
U3KQ87 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
U3KQ87 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
U3KQ87 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
U3KQ87 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
U3KQ87 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
U3KQ87 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
U3KQ87 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
U3KQ87 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
U3KQ87 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
U3KQ87 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
U3KQ87 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
U3KQ87 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
U3KQ87 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
U3KQ87 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
U3KQ87 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
U3KQ87 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
U3KQ87 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
U3KQ87 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
U3KQ87 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
U3KQ87 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
U3KQ87 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
U3KQ87 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
U3KQ87 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
U3KQ87 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
U3KQ87 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
U3KQ87 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
U3KQ87 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
U3KQ87 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
U3KQ87 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
U3KQ87 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
U3KQ87 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
U3KQ87 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
U3KQ87 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
U3KQ87 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
U3KQ87 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
U3KQ87 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
U3KQ87 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
U3KQ87 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
U3KQ87 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
U3KQ87 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
U3KQ87 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
U3KQ87 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
U3KQ87 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
U3KQ87 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms