Protein–RNA interactions for Protein: R4GMX3

COMMD3-BMI1, COMMD3-BMI1 readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD3-BMI1R4GMX3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
COMMD3-BMI1R4GMX3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
COMMD3-BMI1R4GMX3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
COMMD3-BMI1R4GMX3 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
COMMD3-BMI1R4GMX3 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26■■□□□ 1.75
COMMD3-BMI1R4GMX3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
COMMD3-BMI1R4GMX3 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
COMMD3-BMI1R4GMX3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
COMMD3-BMI1R4GMX3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
COMMD3-BMI1R4GMX3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
COMMD3-BMI1R4GMX3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
COMMD3-BMI1R4GMX3 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
COMMD3-BMI1R4GMX3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
COMMD3-BMI1R4GMX3 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
COMMD3-BMI1R4GMX3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
COMMD3-BMI1R4GMX3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
COMMD3-BMI1R4GMX3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
COMMD3-BMI1R4GMX3 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
COMMD3-BMI1R4GMX3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
COMMD3-BMI1R4GMX3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
COMMD3-BMI1R4GMX3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
COMMD3-BMI1R4GMX3 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
COMMD3-BMI1R4GMX3 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
COMMD3-BMI1R4GMX3 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
COMMD3-BMI1R4GMX3 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
COMMD3-BMI1R4GMX3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
COMMD3-BMI1R4GMX3 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
COMMD3-BMI1R4GMX3 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
COMMD3-BMI1R4GMX3 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
COMMD3-BMI1R4GMX3 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
COMMD3-BMI1R4GMX3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
COMMD3-BMI1R4GMX3 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
COMMD3-BMI1R4GMX3 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
COMMD3-BMI1R4GMX3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
COMMD3-BMI1R4GMX3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
COMMD3-BMI1R4GMX3 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
COMMD3-BMI1R4GMX3 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
COMMD3-BMI1R4GMX3 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
COMMD3-BMI1R4GMX3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
COMMD3-BMI1R4GMX3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
COMMD3-BMI1R4GMX3 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
COMMD3-BMI1R4GMX3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
COMMD3-BMI1R4GMX3 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
COMMD3-BMI1R4GMX3 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
COMMD3-BMI1R4GMX3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
COMMD3-BMI1R4GMX3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
COMMD3-BMI1R4GMX3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
COMMD3-BMI1R4GMX3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
COMMD3-BMI1R4GMX3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
COMMD3-BMI1R4GMX3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
COMMD3-BMI1R4GMX3 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
COMMD3-BMI1R4GMX3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
COMMD3-BMI1R4GMX3 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
COMMD3-BMI1R4GMX3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
COMMD3-BMI1R4GMX3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
COMMD3-BMI1R4GMX3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
COMMD3-BMI1R4GMX3 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
COMMD3-BMI1R4GMX3 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
COMMD3-BMI1R4GMX3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
COMMD3-BMI1R4GMX3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
COMMD3-BMI1R4GMX3 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
COMMD3-BMI1R4GMX3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
COMMD3-BMI1R4GMX3 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
COMMD3-BMI1R4GMX3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
COMMD3-BMI1R4GMX3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
COMMD3-BMI1R4GMX3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
COMMD3-BMI1R4GMX3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
COMMD3-BMI1R4GMX3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
COMMD3-BMI1R4GMX3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
COMMD3-BMI1R4GMX3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
COMMD3-BMI1R4GMX3 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
COMMD3-BMI1R4GMX3 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
COMMD3-BMI1R4GMX3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
COMMD3-BMI1R4GMX3 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
COMMD3-BMI1R4GMX3 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
COMMD3-BMI1R4GMX3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
COMMD3-BMI1R4GMX3 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
COMMD3-BMI1R4GMX3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
COMMD3-BMI1R4GMX3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
COMMD3-BMI1R4GMX3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
COMMD3-BMI1R4GMX3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
COMMD3-BMI1R4GMX3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
COMMD3-BMI1R4GMX3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
COMMD3-BMI1R4GMX3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
COMMD3-BMI1R4GMX3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
COMMD3-BMI1R4GMX3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
COMMD3-BMI1R4GMX3 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
COMMD3-BMI1R4GMX3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
COMMD3-BMI1R4GMX3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
COMMD3-BMI1R4GMX3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
COMMD3-BMI1R4GMX3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
COMMD3-BMI1R4GMX3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
COMMD3-BMI1R4GMX3 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
COMMD3-BMI1R4GMX3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
COMMD3-BMI1R4GMX3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
COMMD3-BMI1R4GMX3 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
COMMD3-BMI1R4GMX3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
COMMD3-BMI1R4GMX3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
COMMD3-BMI1R4GMX3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
COMMD3-BMI1R4GMX3 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms