Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y625

GPC6, Glypican-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC6Q9Y625 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GPC6Q9Y625 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GPC6Q9Y625 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GPC6Q9Y625 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GPC6Q9Y625 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GPC6Q9Y625 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GPC6Q9Y625 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GPC6Q9Y625 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GPC6Q9Y625 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GPC6Q9Y625 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
GPC6Q9Y625 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GPC6Q9Y625 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GPC6Q9Y625 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GPC6Q9Y625 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GPC6Q9Y625 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GPC6Q9Y625 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GPC6Q9Y625 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GPC6Q9Y625 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GPC6Q9Y625 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GPC6Q9Y625 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
GPC6Q9Y625 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GPC6Q9Y625 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GPC6Q9Y625 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GPC6Q9Y625 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GPC6Q9Y625 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GPC6Q9Y625 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GPC6Q9Y625 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GPC6Q9Y625 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
GPC6Q9Y625 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GPC6Q9Y625 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GPC6Q9Y625 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GPC6Q9Y625 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GPC6Q9Y625 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GPC6Q9Y625 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
GPC6Q9Y625 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GPC6Q9Y625 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GPC6Q9Y625 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GPC6Q9Y625 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GPC6Q9Y625 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GPC6Q9Y625 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GPC6Q9Y625 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GPC6Q9Y625 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GPC6Q9Y625 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GPC6Q9Y625 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GPC6Q9Y625 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GPC6Q9Y625 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GPC6Q9Y625 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GPC6Q9Y625 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GPC6Q9Y625 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GPC6Q9Y625 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GPC6Q9Y625 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GPC6Q9Y625 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GPC6Q9Y625 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GPC6Q9Y625 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GPC6Q9Y625 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GPC6Q9Y625 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GPC6Q9Y625 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GPC6Q9Y625 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GPC6Q9Y625 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GPC6Q9Y625 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GPC6Q9Y625 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GPC6Q9Y625 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GPC6Q9Y625 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GPC6Q9Y625 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GPC6Q9Y625 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GPC6Q9Y625 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GPC6Q9Y625 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GPC6Q9Y625 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GPC6Q9Y625 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GPC6Q9Y625 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GPC6Q9Y625 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GPC6Q9Y625 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
GPC6Q9Y625 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
GPC6Q9Y625 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
GPC6Q9Y625 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GPC6Q9Y625 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GPC6Q9Y625 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GPC6Q9Y625 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GPC6Q9Y625 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GPC6Q9Y625 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GPC6Q9Y625 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GPC6Q9Y625 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
GPC6Q9Y625 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GPC6Q9Y625 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GPC6Q9Y625 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GPC6Q9Y625 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GPC6Q9Y625 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GPC6Q9Y625 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GPC6Q9Y625 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GPC6Q9Y625 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GPC6Q9Y625 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GPC6Q9Y625 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GPC6Q9Y625 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GPC6Q9Y625 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GPC6Q9Y625 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GPC6Q9Y625 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GPC6Q9Y625 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GPC6Q9Y625 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GPC6Q9Y625 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GPC6Q9Y625 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms