Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKN5

PRDM4, PR domain zinc finger protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM4Q9UKN5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PRDM4Q9UKN5 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PRDM4Q9UKN5 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PRDM4Q9UKN5 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PRDM4Q9UKN5 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PRDM4Q9UKN5 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.25
PRDM4Q9UKN5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
PRDM4Q9UKN5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PRDM4Q9UKN5 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PRDM4Q9UKN5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PRDM4Q9UKN5 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PRDM4Q9UKN5 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PRDM4Q9UKN5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PRDM4Q9UKN5 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PRDM4Q9UKN5 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PRDM4Q9UKN5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PRDM4Q9UKN5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PRDM4Q9UKN5 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PRDM4Q9UKN5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PRDM4Q9UKN5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PRDM4Q9UKN5 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PRDM4Q9UKN5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PRDM4Q9UKN5 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PRDM4Q9UKN5 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PRDM4Q9UKN5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PRDM4Q9UKN5 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PRDM4Q9UKN5 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
PRDM4Q9UKN5 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PRDM4Q9UKN5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PRDM4Q9UKN5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PRDM4Q9UKN5 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PRDM4Q9UKN5 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PRDM4Q9UKN5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PRDM4Q9UKN5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PRDM4Q9UKN5 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PRDM4Q9UKN5 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PRDM4Q9UKN5 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PRDM4Q9UKN5 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PRDM4Q9UKN5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PRDM4Q9UKN5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PRDM4Q9UKN5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PRDM4Q9UKN5 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PRDM4Q9UKN5 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PRDM4Q9UKN5 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PRDM4Q9UKN5 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PRDM4Q9UKN5 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PRDM4Q9UKN5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PRDM4Q9UKN5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PRDM4Q9UKN5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PRDM4Q9UKN5 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PRDM4Q9UKN5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PRDM4Q9UKN5 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PRDM4Q9UKN5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PRDM4Q9UKN5 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PRDM4Q9UKN5 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PRDM4Q9UKN5 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PRDM4Q9UKN5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PRDM4Q9UKN5 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PRDM4Q9UKN5 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PRDM4Q9UKN5 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PRDM4Q9UKN5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PRDM4Q9UKN5 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PRDM4Q9UKN5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PRDM4Q9UKN5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PRDM4Q9UKN5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PRDM4Q9UKN5 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PRDM4Q9UKN5 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PRDM4Q9UKN5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PRDM4Q9UKN5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PRDM4Q9UKN5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PRDM4Q9UKN5 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PRDM4Q9UKN5 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PRDM4Q9UKN5 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PRDM4Q9UKN5 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PRDM4Q9UKN5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PRDM4Q9UKN5 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PRDM4Q9UKN5 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
PRDM4Q9UKN5 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PRDM4Q9UKN5 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PRDM4Q9UKN5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PRDM4Q9UKN5 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PRDM4Q9UKN5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PRDM4Q9UKN5 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PRDM4Q9UKN5 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PRDM4Q9UKN5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PRDM4Q9UKN5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PRDM4Q9UKN5 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PRDM4Q9UKN5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PRDM4Q9UKN5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PRDM4Q9UKN5 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PRDM4Q9UKN5 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PRDM4Q9UKN5 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PRDM4Q9UKN5 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PRDM4Q9UKN5 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
PRDM4Q9UKN5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PRDM4Q9UKN5 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PRDM4Q9UKN5 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PRDM4Q9UKN5 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PRDM4Q9UKN5 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PRDM4Q9UKN5 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms