Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBR5

CKLF, Chemokine-like factor, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKLFQ9UBR5 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CKLFQ9UBR5 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CKLFQ9UBR5 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CKLFQ9UBR5 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CKLFQ9UBR5 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CKLFQ9UBR5 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CKLFQ9UBR5 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CKLFQ9UBR5 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CKLFQ9UBR5 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CKLFQ9UBR5 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CKLFQ9UBR5 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CKLFQ9UBR5 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CKLFQ9UBR5 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CKLFQ9UBR5 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CKLFQ9UBR5 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CKLFQ9UBR5 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CKLFQ9UBR5 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CKLFQ9UBR5 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CKLFQ9UBR5 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CKLFQ9UBR5 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CKLFQ9UBR5 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CKLFQ9UBR5 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CKLFQ9UBR5 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CKLFQ9UBR5 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CKLFQ9UBR5 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CKLFQ9UBR5 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CKLFQ9UBR5 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CKLFQ9UBR5 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CKLFQ9UBR5 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CKLFQ9UBR5 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CKLFQ9UBR5 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CKLFQ9UBR5 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CKLFQ9UBR5 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CKLFQ9UBR5 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CKLFQ9UBR5 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CKLFQ9UBR5 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CKLFQ9UBR5 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CKLFQ9UBR5 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CKLFQ9UBR5 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CKLFQ9UBR5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CKLFQ9UBR5 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CKLFQ9UBR5 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CKLFQ9UBR5 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CKLFQ9UBR5 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CKLFQ9UBR5 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CKLFQ9UBR5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CKLFQ9UBR5 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CKLFQ9UBR5 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CKLFQ9UBR5 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CKLFQ9UBR5 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CKLFQ9UBR5 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CKLFQ9UBR5 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CKLFQ9UBR5 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CKLFQ9UBR5 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CKLFQ9UBR5 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CKLFQ9UBR5 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CKLFQ9UBR5 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CKLFQ9UBR5 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CKLFQ9UBR5 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CKLFQ9UBR5 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CKLFQ9UBR5 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CKLFQ9UBR5 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CKLFQ9UBR5 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CKLFQ9UBR5 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CKLFQ9UBR5 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CKLFQ9UBR5 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CKLFQ9UBR5 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CKLFQ9UBR5 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CKLFQ9UBR5 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CKLFQ9UBR5 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CKLFQ9UBR5 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CKLFQ9UBR5 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CKLFQ9UBR5 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CKLFQ9UBR5 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CKLFQ9UBR5 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CKLFQ9UBR5 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CKLFQ9UBR5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CKLFQ9UBR5 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CKLFQ9UBR5 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CKLFQ9UBR5 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CKLFQ9UBR5 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CKLFQ9UBR5 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CKLFQ9UBR5 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CKLFQ9UBR5 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CKLFQ9UBR5 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CKLFQ9UBR5 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CKLFQ9UBR5 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CKLFQ9UBR5 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CKLFQ9UBR5 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CKLFQ9UBR5 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CKLFQ9UBR5 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CKLFQ9UBR5 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CKLFQ9UBR5 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CKLFQ9UBR5 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CKLFQ9UBR5 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CKLFQ9UBR5 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CKLFQ9UBR5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CKLFQ9UBR5 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CKLFQ9UBR5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CKLFQ9UBR5 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms