Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.56■■■□□ 2
SPASTQ9UBP0 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SPASTQ9UBP0 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SPASTQ9UBP0 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SPASTQ9UBP0 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
SPASTQ9UBP0 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SPASTQ9UBP0 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SPASTQ9UBP0 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SPASTQ9UBP0 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SPASTQ9UBP0 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SPASTQ9UBP0 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SPASTQ9UBP0 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SPASTQ9UBP0 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SPASTQ9UBP0 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SPASTQ9UBP0 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SPASTQ9UBP0 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SPASTQ9UBP0 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SPASTQ9UBP0 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SPASTQ9UBP0 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SPASTQ9UBP0 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SPASTQ9UBP0 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SPASTQ9UBP0 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SPASTQ9UBP0 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SPASTQ9UBP0 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SPASTQ9UBP0 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SPASTQ9UBP0 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SPASTQ9UBP0 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
SPASTQ9UBP0 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
SPASTQ9UBP0 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
SPASTQ9UBP0 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SPASTQ9UBP0 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SPASTQ9UBP0 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SPASTQ9UBP0 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SPASTQ9UBP0 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SPASTQ9UBP0 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
SPASTQ9UBP0 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SPASTQ9UBP0 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SPASTQ9UBP0 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SPASTQ9UBP0 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SPASTQ9UBP0 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SPASTQ9UBP0 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SPASTQ9UBP0 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SPASTQ9UBP0 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SPASTQ9UBP0 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
SPASTQ9UBP0 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SPASTQ9UBP0 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SPASTQ9UBP0 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SPASTQ9UBP0 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SPASTQ9UBP0 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SPASTQ9UBP0 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SPASTQ9UBP0 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SPASTQ9UBP0 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SPASTQ9UBP0 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SPASTQ9UBP0 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SPASTQ9UBP0 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SPASTQ9UBP0 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SPASTQ9UBP0 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SPASTQ9UBP0 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SPASTQ9UBP0 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
SPASTQ9UBP0 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SPASTQ9UBP0 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SPASTQ9UBP0 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SPASTQ9UBP0 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SPASTQ9UBP0 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
SPASTQ9UBP0 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SPASTQ9UBP0 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
SPASTQ9UBP0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SPASTQ9UBP0 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SPASTQ9UBP0 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SPASTQ9UBP0 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SPASTQ9UBP0 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SPASTQ9UBP0 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SPASTQ9UBP0 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SPASTQ9UBP0 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SPASTQ9UBP0 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SPASTQ9UBP0 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SPASTQ9UBP0 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SPASTQ9UBP0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SPASTQ9UBP0 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SPASTQ9UBP0 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SPASTQ9UBP0 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SPASTQ9UBP0 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SPASTQ9UBP0 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SPASTQ9UBP0 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
SPASTQ9UBP0 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SPASTQ9UBP0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SPASTQ9UBP0 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SPASTQ9UBP0 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SPASTQ9UBP0 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SPASTQ9UBP0 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SPASTQ9UBP0 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SPASTQ9UBP0 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SPASTQ9UBP0 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SPASTQ9UBP0 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SPASTQ9UBP0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SPASTQ9UBP0 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SPASTQ9UBP0 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SPASTQ9UBP0 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SPASTQ9UBP0 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SPASTQ9UBP0 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 817.5 ms