Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC59.31■■■■■ 7.08
CCDC180Q9P1Z9 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC59.27■■■■■ 7.08
CCDC180Q9P1Z9 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC59.27■■■■■ 7.08
CCDC180Q9P1Z9 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC59.19■■■■■ 7.07
CCDC180Q9P1Z9 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC59.18■■■■■ 7.06
CCDC180Q9P1Z9 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC59.18■■■■■ 7.06
CCDC180Q9P1Z9 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC59.17■■■■■ 7.06
CCDC180Q9P1Z9 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC59.15■■■■■ 7.06
CCDC180Q9P1Z9 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC59.14■■■■■ 7.06
CCDC180Q9P1Z9 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC59.11■■■■■ 7.05
CCDC180Q9P1Z9 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC59.06■■■■■ 7.04
CCDC180Q9P1Z9 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC59.05■■■■■ 7.04
CCDC180Q9P1Z9 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC59.05■■■■■ 7.04
CCDC180Q9P1Z9 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC59.03■■■■■ 7.04
CCDC180Q9P1Z9 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC59.03■■■■■ 7.04
CCDC180Q9P1Z9 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC59.02■■■■■ 7.04
CCDC180Q9P1Z9 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC59.02■■■■■ 7.04
CCDC180Q9P1Z9 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC58.99■■■■■ 7.03
CCDC180Q9P1Z9 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC58.98■■■■■ 7.03
CCDC180Q9P1Z9 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC58.97■■■■■ 7.03
CCDC180Q9P1Z9 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC58.94■■■■■ 7.03
CCDC180Q9P1Z9 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC58.93■■■■■ 7.02
CCDC180Q9P1Z9 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC58.93■■■■■ 7.02
CCDC180Q9P1Z9 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC58.93■■■■■ 7.02
CCDC180Q9P1Z9 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC58.92■■■■■ 7.02
CCDC180Q9P1Z9 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC58.92■■■■■ 7.02
CCDC180Q9P1Z9 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC58.89■■■■■ 7.02
CCDC180Q9P1Z9 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC58.89■■■■■ 7.02
CCDC180Q9P1Z9 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC58.89■■■■■ 7.02
CCDC180Q9P1Z9 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC58.81■■■■■ 7.01
CCDC180Q9P1Z9 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC58.81■■■■■ 7
CCDC180Q9P1Z9 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC58.78■■■■■ 7
CCDC180Q9P1Z9 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC58.71■■■■■ 6.99
CCDC180Q9P1Z9 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC58.67■■■■■ 6.98
CCDC180Q9P1Z9 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC58.64■■■■■ 6.98
CCDC180Q9P1Z9 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC58.63■■■■■ 6.98
CCDC180Q9P1Z9 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC58.63■■■■■ 6.98
CCDC180Q9P1Z9 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC58.61■■■■■ 6.97
CCDC180Q9P1Z9 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC58.61■■■■■ 6.97
CCDC180Q9P1Z9 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC58.6■■■■■ 6.97
CCDC180Q9P1Z9 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC58.59■■■■■ 6.97
CCDC180Q9P1Z9 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC58.56■■■■■ 6.96
CCDC180Q9P1Z9 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC58.52■■■■■ 6.96
CCDC180Q9P1Z9 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC58.52■■■■■ 6.96
CCDC180Q9P1Z9 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC58.51■■■■■ 6.96
CCDC180Q9P1Z9 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC58.46■■■■■ 6.95
CCDC180Q9P1Z9 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC58.45■■■■■ 6.95
CCDC180Q9P1Z9 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC58.45■■■■■ 6.95
CCDC180Q9P1Z9 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC58.45■■■■■ 6.95
CCDC180Q9P1Z9 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC58.42■■■■■ 6.94
CCDC180Q9P1Z9 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC58.42■■■■■ 6.94
CCDC180Q9P1Z9 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC58.42■■■■■ 6.94
CCDC180Q9P1Z9 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC58.41■■■■■ 6.94
CCDC180Q9P1Z9 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC58.41■■■■■ 6.94
CCDC180Q9P1Z9 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC58.41■■■■■ 6.94
CCDC180Q9P1Z9 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC58.39■■■■■ 6.94
CCDC180Q9P1Z9 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC58.38■■■■■ 6.94
CCDC180Q9P1Z9 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC58.38■■■■■ 6.94
CCDC180Q9P1Z9 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC58.3■■■■■ 6.92
CCDC180Q9P1Z9 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC58.29■■■■■ 6.92
CCDC180Q9P1Z9 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC58.26■■■■■ 6.92
CCDC180Q9P1Z9 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC58.25■■■■■ 6.92
CCDC180Q9P1Z9 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC58.22■■■■■ 6.91
CCDC180Q9P1Z9 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC58.19■■■■■ 6.91
CCDC180Q9P1Z9 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC58.16■■■■■ 6.9
CCDC180Q9P1Z9 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC58.16■■■■■ 6.9
CCDC180Q9P1Z9 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC58.15■■■■■ 6.9
CCDC180Q9P1Z9 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC58.14■■■■■ 6.9
CCDC180Q9P1Z9 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC58.14■■■■■ 6.9
CCDC180Q9P1Z9 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC58.14■■■■■ 6.9
CCDC180Q9P1Z9 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC58.12■■■■■ 6.9
CCDC180Q9P1Z9 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC58.12■■■■■ 6.89
CCDC180Q9P1Z9 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC58.09■■■■■ 6.89
CCDC180Q9P1Z9 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC58.08■■■■■ 6.89
CCDC180Q9P1Z9 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC58.06■■■■■ 6.89
CCDC180Q9P1Z9 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC58.06■■■■■ 6.88
CCDC180Q9P1Z9 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC57.97■■■■■ 6.87
CCDC180Q9P1Z9 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC57.97■■■■■ 6.87
CCDC180Q9P1Z9 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC57.94■■■■■ 6.87
CCDC180Q9P1Z9 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC57.93■■■■■ 6.86
CCDC180Q9P1Z9 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC57.93■■■■■ 6.86
CCDC180Q9P1Z9 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC57.92■■■■■ 6.86
CCDC180Q9P1Z9 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC57.9■■■■■ 6.86
CCDC180Q9P1Z9 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC57.89■■■■■ 6.86
CCDC180Q9P1Z9 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC57.89■■■■■ 6.86
CCDC180Q9P1Z9 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC57.88■■■■■ 6.86
CCDC180Q9P1Z9 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC57.88■■■■■ 6.86
CCDC180Q9P1Z9 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC57.85■■■■■ 6.85
CCDC180Q9P1Z9 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC57.85■■■■■ 6.85
CCDC180Q9P1Z9 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC57.81■■■■■ 6.85
CCDC180Q9P1Z9 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC57.81■■■■■ 6.85
CCDC180Q9P1Z9 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC57.81■■■■■ 6.85
CCDC180Q9P1Z9 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC57.77■■■■■ 6.84
CCDC180Q9P1Z9 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC57.76■■■■■ 6.84
CCDC180Q9P1Z9 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC57.75■■■■■ 6.83
CCDC180Q9P1Z9 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC57.74■■■■■ 6.83
CCDC180Q9P1Z9 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC57.72■■■■■ 6.83
CCDC180Q9P1Z9 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC57.71■■■■■ 6.83
CCDC180Q9P1Z9 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC57.67■■■■■ 6.82
CCDC180Q9P1Z9 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC57.67■■■■■ 6.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms