Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC62.12■■■■■ 7.53
CCDC180Q9P1Z9 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC62.06■■■■■ 7.53
CCDC180Q9P1Z9 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC62.05■■■■■ 7.52
CCDC180Q9P1Z9 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC61.97■■■■■ 7.51
CCDC180Q9P1Z9 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC61.92■■■■■ 7.5
CCDC180Q9P1Z9 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC61.84■■■■■ 7.49
CCDC180Q9P1Z9 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC61.77■■■■■ 7.48
CCDC180Q9P1Z9 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC61.75■■■■■ 7.48
CCDC180Q9P1Z9 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC61.72■■■■■ 7.47
CCDC180Q9P1Z9 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC61.7■■■■■ 7.47
CCDC180Q9P1Z9 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC61.66■■■■■ 7.46
CCDC180Q9P1Z9 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC61.62■■■■■ 7.46
CCDC180Q9P1Z9 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC61.59■■■■■ 7.45
CCDC180Q9P1Z9 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC61.58■■■■■ 7.45
CCDC180Q9P1Z9 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC61.53■■■■■ 7.44
CCDC180Q9P1Z9 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC61.51■■■■■ 7.44
CCDC180Q9P1Z9 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC61.47■■■■■ 7.43
CCDC180Q9P1Z9 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC61.33■■■■■ 7.41
CCDC180Q9P1Z9 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC61.3■■■■■ 7.4
CCDC180Q9P1Z9 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC61.29■■■■■ 7.4
CCDC180Q9P1Z9 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC61.28■■■■■ 7.4
CCDC180Q9P1Z9 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC61.27■■■■■ 7.4
CCDC180Q9P1Z9 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC61.23■■■■■ 7.39
CCDC180Q9P1Z9 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC61.21■■■■■ 7.39
CCDC180Q9P1Z9 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC61.14■■■■■ 7.38
CCDC180Q9P1Z9 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC61.12■■■■■ 7.38
CCDC180Q9P1Z9 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC61.11■■■■■ 7.37
CCDC180Q9P1Z9 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC61.07■■■■■ 7.37
CCDC180Q9P1Z9 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC61.05■■■■■ 7.36
CCDC180Q9P1Z9 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC61.05■■■■■ 7.36
CCDC180Q9P1Z9 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC61.01■■■■■ 7.36
CCDC180Q9P1Z9 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC60.94■■■■■ 7.35
CCDC180Q9P1Z9 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC60.89■■■■■ 7.34
CCDC180Q9P1Z9 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC60.89■■■■■ 7.34
CCDC180Q9P1Z9 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC60.88■■■■■ 7.34
CCDC180Q9P1Z9 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC60.85■■■■■ 7.33
CCDC180Q9P1Z9 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC60.82■■■■■ 7.33
CCDC180Q9P1Z9 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC60.78■■■■■ 7.32
CCDC180Q9P1Z9 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC60.78■■■■■ 7.32
CCDC180Q9P1Z9 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC60.77■■■■■ 7.32
CCDC180Q9P1Z9 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC60.75■■■■■ 7.32
CCDC180Q9P1Z9 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC60.74■■■■■ 7.31
CCDC180Q9P1Z9 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC60.73■■■■■ 7.31
CCDC180Q9P1Z9 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC60.72■■■■■ 7.31
CCDC180Q9P1Z9 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC60.67■■■■■ 7.3
CCDC180Q9P1Z9 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC60.67■■■■■ 7.3
CCDC180Q9P1Z9 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC60.63■■■■■ 7.3
CCDC180Q9P1Z9 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC60.6■■■■■ 7.29
CCDC180Q9P1Z9 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC60.6■■■■■ 7.29
CCDC180Q9P1Z9 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC60.59■■■■■ 7.29
CCDC180Q9P1Z9 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC60.58■■■■■ 7.29
CCDC180Q9P1Z9 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC60.46■■■■■ 7.27
CCDC180Q9P1Z9 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC60.45■■■■■ 7.27
CCDC180Q9P1Z9 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC60.38■■■■■ 7.26
CCDC180Q9P1Z9 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC60.37■■■■■ 7.25
CCDC180Q9P1Z9 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC60.34■■■■■ 7.25
CCDC180Q9P1Z9 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC60.32■■■■■ 7.25
CCDC180Q9P1Z9 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC60.31■■■■■ 7.24
CCDC180Q9P1Z9 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC60.27■■■■■ 7.24
CCDC180Q9P1Z9 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC60.21■■■■■ 7.23
CCDC180Q9P1Z9 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC60.21■■■■■ 7.23
CCDC180Q9P1Z9 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC60.18■■■■■ 7.22
CCDC180Q9P1Z9 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC60.02■■■■■ 7.2
CCDC180Q9P1Z9 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC59.99■■■■■ 7.19
CCDC180Q9P1Z9 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC59.95■■■■■ 7.19
CCDC180Q9P1Z9 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC59.91■■■■■ 7.18
CCDC180Q9P1Z9 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC59.91■■■■■ 7.18
CCDC180Q9P1Z9 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC59.89■■■■■ 7.18
CCDC180Q9P1Z9 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC59.89■■■■■ 7.18
CCDC180Q9P1Z9 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC59.89■■■■■ 7.18
CCDC180Q9P1Z9 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC59.87■■■■■ 7.17
CCDC180Q9P1Z9 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC59.83■■■■■ 7.17
CCDC180Q9P1Z9 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC59.81■■■■■ 7.17
CCDC180Q9P1Z9 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC59.78■■■■■ 7.16
CCDC180Q9P1Z9 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC59.74■■■■■ 7.15
CCDC180Q9P1Z9 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC59.72■■■■■ 7.15
CCDC180Q9P1Z9 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC59.71■■■■■ 7.15
CCDC180Q9P1Z9 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC59.71■■■■■ 7.15
CCDC180Q9P1Z9 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC59.7■■■■■ 7.15
CCDC180Q9P1Z9 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC59.64■■■■■ 7.14
CCDC180Q9P1Z9 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC59.62■■■■■ 7.13
CCDC180Q9P1Z9 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC59.6■■■■■ 7.13
CCDC180Q9P1Z9 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC59.58■■■■■ 7.13
CCDC180Q9P1Z9 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC59.57■■■■■ 7.13
CCDC180Q9P1Z9 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC59.57■■■■■ 7.13
CCDC180Q9P1Z9 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC59.54■■■■■ 7.12
CCDC180Q9P1Z9 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC59.54■■■■■ 7.12
CCDC180Q9P1Z9 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC59.52■■■■■ 7.12
CCDC180Q9P1Z9 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC59.52■■■■■ 7.12
CCDC180Q9P1Z9 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC59.51■■■■■ 7.12
CCDC180Q9P1Z9 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC59.51■■■■■ 7.12
CCDC180Q9P1Z9 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC59.5■■■■■ 7.12
CCDC180Q9P1Z9 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC59.5■■■■■ 7.12
CCDC180Q9P1Z9 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC59.5■■■■■ 7.11
CCDC180Q9P1Z9 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC59.48■■■■■ 7.11
CCDC180Q9P1Z9 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC59.48■■■■■ 7.11
CCDC180Q9P1Z9 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC59.48■■■■■ 7.11
CCDC180Q9P1Z9 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC59.4■■■■■ 7.1
CCDC180Q9P1Z9 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC59.35■■■■■ 7.09
CCDC180Q9P1Z9 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC59.32■■■■■ 7.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms