Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1U0

ZNRD1, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA12, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRD1Q9P1U0 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNRD1Q9P1U0 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNRD1Q9P1U0 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNRD1Q9P1U0 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNRD1Q9P1U0 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNRD1Q9P1U0 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNRD1Q9P1U0 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNRD1Q9P1U0 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNRD1Q9P1U0 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNRD1Q9P1U0 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNRD1Q9P1U0 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNRD1Q9P1U0 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNRD1Q9P1U0 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNRD1Q9P1U0 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNRD1Q9P1U0 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNRD1Q9P1U0 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNRD1Q9P1U0 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNRD1Q9P1U0 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNRD1Q9P1U0 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNRD1Q9P1U0 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNRD1Q9P1U0 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNRD1Q9P1U0 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNRD1Q9P1U0 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNRD1Q9P1U0 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNRD1Q9P1U0 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNRD1Q9P1U0 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNRD1Q9P1U0 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNRD1Q9P1U0 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNRD1Q9P1U0 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNRD1Q9P1U0 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNRD1Q9P1U0 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNRD1Q9P1U0 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNRD1Q9P1U0 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNRD1Q9P1U0 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNRD1Q9P1U0 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNRD1Q9P1U0 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNRD1Q9P1U0 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNRD1Q9P1U0 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNRD1Q9P1U0 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNRD1Q9P1U0 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNRD1Q9P1U0 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNRD1Q9P1U0 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNRD1Q9P1U0 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNRD1Q9P1U0 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNRD1Q9P1U0 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNRD1Q9P1U0 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZNRD1Q9P1U0 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZNRD1Q9P1U0 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNRD1Q9P1U0 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNRD1Q9P1U0 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNRD1Q9P1U0 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNRD1Q9P1U0 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNRD1Q9P1U0 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNRD1Q9P1U0 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNRD1Q9P1U0 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNRD1Q9P1U0 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNRD1Q9P1U0 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNRD1Q9P1U0 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNRD1Q9P1U0 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNRD1Q9P1U0 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNRD1Q9P1U0 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNRD1Q9P1U0 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNRD1Q9P1U0 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNRD1Q9P1U0 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNRD1Q9P1U0 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNRD1Q9P1U0 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNRD1Q9P1U0 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNRD1Q9P1U0 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNRD1Q9P1U0 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNRD1Q9P1U0 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNRD1Q9P1U0 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNRD1Q9P1U0 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNRD1Q9P1U0 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNRD1Q9P1U0 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNRD1Q9P1U0 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNRD1Q9P1U0 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNRD1Q9P1U0 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNRD1Q9P1U0 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNRD1Q9P1U0 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNRD1Q9P1U0 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNRD1Q9P1U0 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNRD1Q9P1U0 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNRD1Q9P1U0 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNRD1Q9P1U0 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNRD1Q9P1U0 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNRD1Q9P1U0 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNRD1Q9P1U0 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNRD1Q9P1U0 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNRD1Q9P1U0 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNRD1Q9P1U0 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNRD1Q9P1U0 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNRD1Q9P1U0 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNRD1Q9P1U0 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNRD1Q9P1U0 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNRD1Q9P1U0 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNRD1Q9P1U0 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNRD1Q9P1U0 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNRD1Q9P1U0 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNRD1Q9P1U0 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNRD1Q9P1U0 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.4 ms