Protein–RNA interactions for Protein: Q9P000

COMMD9, COMM domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD9Q9P000 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COMMD9Q9P000 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
COMMD9Q9P000 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COMMD9Q9P000 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COMMD9Q9P000 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COMMD9Q9P000 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COMMD9Q9P000 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COMMD9Q9P000 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COMMD9Q9P000 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COMMD9Q9P000 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COMMD9Q9P000 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COMMD9Q9P000 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COMMD9Q9P000 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COMMD9Q9P000 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COMMD9Q9P000 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
COMMD9Q9P000 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
COMMD9Q9P000 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
COMMD9Q9P000 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COMMD9Q9P000 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
COMMD9Q9P000 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COMMD9Q9P000 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COMMD9Q9P000 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COMMD9Q9P000 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COMMD9Q9P000 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COMMD9Q9P000 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COMMD9Q9P000 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
COMMD9Q9P000 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
COMMD9Q9P000 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
COMMD9Q9P000 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
COMMD9Q9P000 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COMMD9Q9P000 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COMMD9Q9P000 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COMMD9Q9P000 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COMMD9Q9P000 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COMMD9Q9P000 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
COMMD9Q9P000 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COMMD9Q9P000 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COMMD9Q9P000 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COMMD9Q9P000 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COMMD9Q9P000 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COMMD9Q9P000 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COMMD9Q9P000 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
COMMD9Q9P000 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
COMMD9Q9P000 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COMMD9Q9P000 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
COMMD9Q9P000 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
COMMD9Q9P000 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
COMMD9Q9P000 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COMMD9Q9P000 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
COMMD9Q9P000 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
COMMD9Q9P000 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COMMD9Q9P000 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
COMMD9Q9P000 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
COMMD9Q9P000 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
COMMD9Q9P000 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
COMMD9Q9P000 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
COMMD9Q9P000 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
COMMD9Q9P000 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
COMMD9Q9P000 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
COMMD9Q9P000 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
COMMD9Q9P000 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COMMD9Q9P000 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
COMMD9Q9P000 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COMMD9Q9P000 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COMMD9Q9P000 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
COMMD9Q9P000 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COMMD9Q9P000 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
COMMD9Q9P000 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
COMMD9Q9P000 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
COMMD9Q9P000 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
COMMD9Q9P000 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
COMMD9Q9P000 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
COMMD9Q9P000 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COMMD9Q9P000 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COMMD9Q9P000 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
COMMD9Q9P000 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COMMD9Q9P000 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
COMMD9Q9P000 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COMMD9Q9P000 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
COMMD9Q9P000 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
COMMD9Q9P000 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
COMMD9Q9P000 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COMMD9Q9P000 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COMMD9Q9P000 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
COMMD9Q9P000 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COMMD9Q9P000 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COMMD9Q9P000 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COMMD9Q9P000 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COMMD9Q9P000 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COMMD9Q9P000 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COMMD9Q9P000 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COMMD9Q9P000 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COMMD9Q9P000 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COMMD9Q9P000 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COMMD9Q9P000 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COMMD9Q9P000 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COMMD9Q9P000 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COMMD9Q9P000 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COMMD9Q9P000 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COMMD9Q9P000 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.4 ms