Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZR2

LRP1B, Low-density lipoprotein receptor-related protein 1B, humanhuman

Predictions only

Length 4,599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1BQ9NZR2 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRP1BQ9NZR2 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRP1BQ9NZR2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
LRP1BQ9NZR2 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRP1BQ9NZR2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRP1BQ9NZR2 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRP1BQ9NZR2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
LRP1BQ9NZR2 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRP1BQ9NZR2 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
LRP1BQ9NZR2 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRP1BQ9NZR2 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRP1BQ9NZR2 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRP1BQ9NZR2 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRP1BQ9NZR2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
LRP1BQ9NZR2 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRP1BQ9NZR2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
LRP1BQ9NZR2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRP1BQ9NZR2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LRP1BQ9NZR2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
LRP1BQ9NZR2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LRP1BQ9NZR2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LRP1BQ9NZR2 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LRP1BQ9NZR2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LRP1BQ9NZR2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LRP1BQ9NZR2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
LRP1BQ9NZR2 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LRP1BQ9NZR2 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LRP1BQ9NZR2 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LRP1BQ9NZR2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LRP1BQ9NZR2 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LRP1BQ9NZR2 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LRP1BQ9NZR2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LRP1BQ9NZR2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LRP1BQ9NZR2 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LRP1BQ9NZR2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LRP1BQ9NZR2 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LRP1BQ9NZR2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LRP1BQ9NZR2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LRP1BQ9NZR2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LRP1BQ9NZR2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRP1BQ9NZR2 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRP1BQ9NZR2 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRP1BQ9NZR2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRP1BQ9NZR2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRP1BQ9NZR2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRP1BQ9NZR2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRP1BQ9NZR2 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRP1BQ9NZR2 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRP1BQ9NZR2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRP1BQ9NZR2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LRP1BQ9NZR2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRP1BQ9NZR2 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRP1BQ9NZR2 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRP1BQ9NZR2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRP1BQ9NZR2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRP1BQ9NZR2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRP1BQ9NZR2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRP1BQ9NZR2 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LRP1BQ9NZR2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LRP1BQ9NZR2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LRP1BQ9NZR2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
LRP1BQ9NZR2 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
LRP1BQ9NZR2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRP1BQ9NZR2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRP1BQ9NZR2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LRP1BQ9NZR2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
LRP1BQ9NZR2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
LRP1BQ9NZR2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LRP1BQ9NZR2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LRP1BQ9NZR2 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LRP1BQ9NZR2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LRP1BQ9NZR2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LRP1BQ9NZR2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LRP1BQ9NZR2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LRP1BQ9NZR2 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.46
LRP1BQ9NZR2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LRP1BQ9NZR2 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LRP1BQ9NZR2 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LRP1BQ9NZR2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LRP1BQ9NZR2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LRP1BQ9NZR2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LRP1BQ9NZR2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LRP1BQ9NZR2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
LRP1BQ9NZR2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LRP1BQ9NZR2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LRP1BQ9NZR2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRP1BQ9NZR2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRP1BQ9NZR2 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRP1BQ9NZR2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRP1BQ9NZR2 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LRP1BQ9NZR2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LRP1BQ9NZR2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LRP1BQ9NZR2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRP1BQ9NZR2 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRP1BQ9NZR2 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRP1BQ9NZR2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRP1BQ9NZR2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRP1BQ9NZR2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRP1BQ9NZR2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LRP1BQ9NZR2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms