Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZP8

C1RL, Complement C1r subcomponent-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1RLQ9NZP8 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C1RLQ9NZP8 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
C1RLQ9NZP8 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C1RLQ9NZP8 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C1RLQ9NZP8 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C1RLQ9NZP8 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C1RLQ9NZP8 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C1RLQ9NZP8 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C1RLQ9NZP8 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C1RLQ9NZP8 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C1RLQ9NZP8 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C1RLQ9NZP8 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C1RLQ9NZP8 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C1RLQ9NZP8 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C1RLQ9NZP8 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C1RLQ9NZP8 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C1RLQ9NZP8 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C1RLQ9NZP8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C1RLQ9NZP8 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C1RLQ9NZP8 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C1RLQ9NZP8 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C1RLQ9NZP8 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C1RLQ9NZP8 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C1RLQ9NZP8 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C1RLQ9NZP8 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C1RLQ9NZP8 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C1RLQ9NZP8 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C1RLQ9NZP8 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C1RLQ9NZP8 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C1RLQ9NZP8 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C1RLQ9NZP8 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C1RLQ9NZP8 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C1RLQ9NZP8 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C1RLQ9NZP8 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C1RLQ9NZP8 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C1RLQ9NZP8 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C1RLQ9NZP8 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
C1RLQ9NZP8 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C1RLQ9NZP8 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C1RLQ9NZP8 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C1RLQ9NZP8 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1RLQ9NZP8 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1RLQ9NZP8 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C1RLQ9NZP8 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C1RLQ9NZP8 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1RLQ9NZP8 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1RLQ9NZP8 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1RLQ9NZP8 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
C1RLQ9NZP8 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1RLQ9NZP8 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C1RLQ9NZP8 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C1RLQ9NZP8 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C1RLQ9NZP8 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C1RLQ9NZP8 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C1RLQ9NZP8 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
C1RLQ9NZP8 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C1RLQ9NZP8 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C1RLQ9NZP8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C1RLQ9NZP8 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C1RLQ9NZP8 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C1RLQ9NZP8 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C1RLQ9NZP8 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C1RLQ9NZP8 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
C1RLQ9NZP8 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C1RLQ9NZP8 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
C1RLQ9NZP8 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C1RLQ9NZP8 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C1RLQ9NZP8 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C1RLQ9NZP8 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C1RLQ9NZP8 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C1RLQ9NZP8 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C1RLQ9NZP8 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C1RLQ9NZP8 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C1RLQ9NZP8 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C1RLQ9NZP8 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C1RLQ9NZP8 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1RLQ9NZP8 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
C1RLQ9NZP8 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C1RLQ9NZP8 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1RLQ9NZP8 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1RLQ9NZP8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1RLQ9NZP8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1RLQ9NZP8 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1RLQ9NZP8 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
C1RLQ9NZP8 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1RLQ9NZP8 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1RLQ9NZP8 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1RLQ9NZP8 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1RLQ9NZP8 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1RLQ9NZP8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1RLQ9NZP8 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1RLQ9NZP8 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1RLQ9NZP8 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1RLQ9NZP8 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1RLQ9NZP8 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1RLQ9NZP8 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C1RLQ9NZP8 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1RLQ9NZP8 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1RLQ9NZP8 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1RLQ9NZP8 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.8 ms