Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZP6

NPAP1, Nuclear pore-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAP1Q9NZP6 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NPAP1Q9NZP6 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NPAP1Q9NZP6 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NPAP1Q9NZP6 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NPAP1Q9NZP6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NPAP1Q9NZP6 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NPAP1Q9NZP6 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NPAP1Q9NZP6 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NPAP1Q9NZP6 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NPAP1Q9NZP6 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NPAP1Q9NZP6 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NPAP1Q9NZP6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NPAP1Q9NZP6 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NPAP1Q9NZP6 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NPAP1Q9NZP6 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
NPAP1Q9NZP6 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NPAP1Q9NZP6 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NPAP1Q9NZP6 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NPAP1Q9NZP6 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NPAP1Q9NZP6 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NPAP1Q9NZP6 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NPAP1Q9NZP6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NPAP1Q9NZP6 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NPAP1Q9NZP6 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NPAP1Q9NZP6 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NPAP1Q9NZP6 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NPAP1Q9NZP6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
NPAP1Q9NZP6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NPAP1Q9NZP6 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NPAP1Q9NZP6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NPAP1Q9NZP6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NPAP1Q9NZP6 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NPAP1Q9NZP6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NPAP1Q9NZP6 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NPAP1Q9NZP6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NPAP1Q9NZP6 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NPAP1Q9NZP6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NPAP1Q9NZP6 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NPAP1Q9NZP6 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NPAP1Q9NZP6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NPAP1Q9NZP6 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NPAP1Q9NZP6 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NPAP1Q9NZP6 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NPAP1Q9NZP6 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NPAP1Q9NZP6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NPAP1Q9NZP6 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NPAP1Q9NZP6 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NPAP1Q9NZP6 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NPAP1Q9NZP6 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NPAP1Q9NZP6 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NPAP1Q9NZP6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NPAP1Q9NZP6 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NPAP1Q9NZP6 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NPAP1Q9NZP6 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NPAP1Q9NZP6 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NPAP1Q9NZP6 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NPAP1Q9NZP6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NPAP1Q9NZP6 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NPAP1Q9NZP6 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NPAP1Q9NZP6 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NPAP1Q9NZP6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NPAP1Q9NZP6 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NPAP1Q9NZP6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NPAP1Q9NZP6 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NPAP1Q9NZP6 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NPAP1Q9NZP6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NPAP1Q9NZP6 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NPAP1Q9NZP6 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NPAP1Q9NZP6 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NPAP1Q9NZP6 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NPAP1Q9NZP6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NPAP1Q9NZP6 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NPAP1Q9NZP6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NPAP1Q9NZP6 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NPAP1Q9NZP6 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NPAP1Q9NZP6 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NPAP1Q9NZP6 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
NPAP1Q9NZP6 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NPAP1Q9NZP6 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NPAP1Q9NZP6 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NPAP1Q9NZP6 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NPAP1Q9NZP6 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NPAP1Q9NZP6 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NPAP1Q9NZP6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NPAP1Q9NZP6 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NPAP1Q9NZP6 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NPAP1Q9NZP6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NPAP1Q9NZP6 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NPAP1Q9NZP6 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NPAP1Q9NZP6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NPAP1Q9NZP6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
NPAP1Q9NZP6 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NPAP1Q9NZP6 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NPAP1Q9NZP6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NPAP1Q9NZP6 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NPAP1Q9NZP6 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NPAP1Q9NZP6 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NPAP1Q9NZP6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NPAP1Q9NZP6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NPAP1Q9NZP6 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.5 ms