Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX63

CHCHD3, MICOS complex subunit MIC19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD3Q9NX63 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHCHD3Q9NX63 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHCHD3Q9NX63 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHCHD3Q9NX63 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHCHD3Q9NX63 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHCHD3Q9NX63 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHCHD3Q9NX63 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHCHD3Q9NX63 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHCHD3Q9NX63 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHCHD3Q9NX63 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHCHD3Q9NX63 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHCHD3Q9NX63 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
CHCHD3Q9NX63 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHCHD3Q9NX63 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHCHD3Q9NX63 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHCHD3Q9NX63 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHCHD3Q9NX63 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHCHD3Q9NX63 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHCHD3Q9NX63 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHCHD3Q9NX63 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHCHD3Q9NX63 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHCHD3Q9NX63 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHCHD3Q9NX63 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHCHD3Q9NX63 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHCHD3Q9NX63 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHCHD3Q9NX63 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHCHD3Q9NX63 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHCHD3Q9NX63 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHCHD3Q9NX63 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHCHD3Q9NX63 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHCHD3Q9NX63 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CHCHD3Q9NX63 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CHCHD3Q9NX63 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHCHD3Q9NX63 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHCHD3Q9NX63 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHCHD3Q9NX63 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHCHD3Q9NX63 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CHCHD3Q9NX63 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CHCHD3Q9NX63 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHCHD3Q9NX63 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHCHD3Q9NX63 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHCHD3Q9NX63 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHCHD3Q9NX63 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHCHD3Q9NX63 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHCHD3Q9NX63 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHCHD3Q9NX63 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHCHD3Q9NX63 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHCHD3Q9NX63 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHCHD3Q9NX63 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHCHD3Q9NX63 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHCHD3Q9NX63 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHCHD3Q9NX63 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHCHD3Q9NX63 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHCHD3Q9NX63 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHCHD3Q9NX63 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHCHD3Q9NX63 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CHCHD3Q9NX63 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHCHD3Q9NX63 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHCHD3Q9NX63 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHCHD3Q9NX63 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHCHD3Q9NX63 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHCHD3Q9NX63 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHCHD3Q9NX63 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHCHD3Q9NX63 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHCHD3Q9NX63 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHCHD3Q9NX63 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHCHD3Q9NX63 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHCHD3Q9NX63 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHCHD3Q9NX63 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHCHD3Q9NX63 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHCHD3Q9NX63 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHCHD3Q9NX63 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHCHD3Q9NX63 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHCHD3Q9NX63 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHCHD3Q9NX63 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHCHD3Q9NX63 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHCHD3Q9NX63 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHCHD3Q9NX63 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHCHD3Q9NX63 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHCHD3Q9NX63 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHCHD3Q9NX63 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHCHD3Q9NX63 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHCHD3Q9NX63 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHCHD3Q9NX63 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHCHD3Q9NX63 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHCHD3Q9NX63 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHCHD3Q9NX63 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHCHD3Q9NX63 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHCHD3Q9NX63 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHCHD3Q9NX63 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHCHD3Q9NX63 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHCHD3Q9NX63 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHCHD3Q9NX63 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHCHD3Q9NX63 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHCHD3Q9NX63 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHCHD3Q9NX63 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHCHD3Q9NX63 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHCHD3Q9NX63 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHCHD3Q9NX63 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHCHD3Q9NX63 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms