Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVZ3

NECAP2, Adaptin ear-binding coat-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECAP2Q9NVZ3 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NECAP2Q9NVZ3 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NECAP2Q9NVZ3 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NECAP2Q9NVZ3 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NECAP2Q9NVZ3 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NECAP2Q9NVZ3 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NECAP2Q9NVZ3 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NECAP2Q9NVZ3 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NECAP2Q9NVZ3 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NECAP2Q9NVZ3 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NECAP2Q9NVZ3 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NECAP2Q9NVZ3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NECAP2Q9NVZ3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NECAP2Q9NVZ3 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NECAP2Q9NVZ3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NECAP2Q9NVZ3 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NECAP2Q9NVZ3 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NECAP2Q9NVZ3 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NECAP2Q9NVZ3 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NECAP2Q9NVZ3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NECAP2Q9NVZ3 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NECAP2Q9NVZ3 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NECAP2Q9NVZ3 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NECAP2Q9NVZ3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NECAP2Q9NVZ3 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NECAP2Q9NVZ3 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NECAP2Q9NVZ3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NECAP2Q9NVZ3 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NECAP2Q9NVZ3 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NECAP2Q9NVZ3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NECAP2Q9NVZ3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NECAP2Q9NVZ3 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NECAP2Q9NVZ3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NECAP2Q9NVZ3 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NECAP2Q9NVZ3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NECAP2Q9NVZ3 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NECAP2Q9NVZ3 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NECAP2Q9NVZ3 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NECAP2Q9NVZ3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NECAP2Q9NVZ3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NECAP2Q9NVZ3 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NECAP2Q9NVZ3 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NECAP2Q9NVZ3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NECAP2Q9NVZ3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NECAP2Q9NVZ3 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NECAP2Q9NVZ3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NECAP2Q9NVZ3 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
NECAP2Q9NVZ3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NECAP2Q9NVZ3 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NECAP2Q9NVZ3 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NECAP2Q9NVZ3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NECAP2Q9NVZ3 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NECAP2Q9NVZ3 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NECAP2Q9NVZ3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NECAP2Q9NVZ3 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NECAP2Q9NVZ3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NECAP2Q9NVZ3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NECAP2Q9NVZ3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NECAP2Q9NVZ3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NECAP2Q9NVZ3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NECAP2Q9NVZ3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NECAP2Q9NVZ3 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NECAP2Q9NVZ3 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NECAP2Q9NVZ3 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NECAP2Q9NVZ3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NECAP2Q9NVZ3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NECAP2Q9NVZ3 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NECAP2Q9NVZ3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NECAP2Q9NVZ3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NECAP2Q9NVZ3 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NECAP2Q9NVZ3 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NECAP2Q9NVZ3 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NECAP2Q9NVZ3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NECAP2Q9NVZ3 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NECAP2Q9NVZ3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NECAP2Q9NVZ3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NECAP2Q9NVZ3 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NECAP2Q9NVZ3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NECAP2Q9NVZ3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NECAP2Q9NVZ3 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NECAP2Q9NVZ3 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NECAP2Q9NVZ3 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NECAP2Q9NVZ3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NECAP2Q9NVZ3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NECAP2Q9NVZ3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NECAP2Q9NVZ3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NECAP2Q9NVZ3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NECAP2Q9NVZ3 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NECAP2Q9NVZ3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NECAP2Q9NVZ3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NECAP2Q9NVZ3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NECAP2Q9NVZ3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NECAP2Q9NVZ3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NECAP2Q9NVZ3 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NECAP2Q9NVZ3 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NECAP2Q9NVZ3 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NECAP2Q9NVZ3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NECAP2Q9NVZ3 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NECAP2Q9NVZ3 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NECAP2Q9NVZ3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms