Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS56

TOPORS, E3 ubiquitin-protein ligase Topors, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,045 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPORSQ9NS56 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
TOPORSQ9NS56 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
TOPORSQ9NS56 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
TOPORSQ9NS56 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.47
TOPORSQ9NS56 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
TOPORSQ9NS56 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
TOPORSQ9NS56 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
TOPORSQ9NS56 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
TOPORSQ9NS56 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
TOPORSQ9NS56 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
TOPORSQ9NS56 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
TOPORSQ9NS56 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
TOPORSQ9NS56 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
TOPORSQ9NS56 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
TOPORSQ9NS56 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
TOPORSQ9NS56 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
TOPORSQ9NS56 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
TOPORSQ9NS56 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
TOPORSQ9NS56 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
TOPORSQ9NS56 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
TOPORSQ9NS56 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
TOPORSQ9NS56 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
TOPORSQ9NS56 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
TOPORSQ9NS56 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
TOPORSQ9NS56 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
TOPORSQ9NS56 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
TOPORSQ9NS56 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
TOPORSQ9NS56 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
TOPORSQ9NS56 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
TOPORSQ9NS56 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC30.21■■■□□ 2.43
TOPORSQ9NS56 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
TOPORSQ9NS56 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
TOPORSQ9NS56 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
TOPORSQ9NS56 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
TOPORSQ9NS56 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
TOPORSQ9NS56 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
TOPORSQ9NS56 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
TOPORSQ9NS56 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
TOPORSQ9NS56 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
TOPORSQ9NS56 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
TOPORSQ9NS56 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
TOPORSQ9NS56 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
TOPORSQ9NS56 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
TOPORSQ9NS56 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
TOPORSQ9NS56 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
TOPORSQ9NS56 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
TOPORSQ9NS56 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
TOPORSQ9NS56 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
TOPORSQ9NS56 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
TOPORSQ9NS56 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
TOPORSQ9NS56 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
TOPORSQ9NS56 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TOPORSQ9NS56 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TOPORSQ9NS56 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TOPORSQ9NS56 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
TOPORSQ9NS56 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
TOPORSQ9NS56 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
TOPORSQ9NS56 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
TOPORSQ9NS56 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
TOPORSQ9NS56 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
TOPORSQ9NS56 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
TOPORSQ9NS56 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
TOPORSQ9NS56 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TOPORSQ9NS56 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
TOPORSQ9NS56 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
TOPORSQ9NS56 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
TOPORSQ9NS56 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
TOPORSQ9NS56 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
TOPORSQ9NS56 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
TOPORSQ9NS56 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TOPORSQ9NS56 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
TOPORSQ9NS56 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
TOPORSQ9NS56 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TOPORSQ9NS56 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
TOPORSQ9NS56 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TOPORSQ9NS56 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TOPORSQ9NS56 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TOPORSQ9NS56 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
TOPORSQ9NS56 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TOPORSQ9NS56 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TOPORSQ9NS56 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.37
TOPORSQ9NS56 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.89■■■□□ 2.37
TOPORSQ9NS56 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TOPORSQ9NS56 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
TOPORSQ9NS56 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TOPORSQ9NS56 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TOPORSQ9NS56 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
TOPORSQ9NS56 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
TOPORSQ9NS56 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TOPORSQ9NS56 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TOPORSQ9NS56 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TOPORSQ9NS56 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TOPORSQ9NS56 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TOPORSQ9NS56 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
TOPORSQ9NS56 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TOPORSQ9NS56 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
TOPORSQ9NS56 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TOPORSQ9NS56 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
TOPORSQ9NS56 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
TOPORSQ9NS56 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms