Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS26

SPANXA1, Sperm protein associated with the nucleus on the X chromosome A, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPANXA1Q9NS26 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPANXA1Q9NS26 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SPANXA1Q9NS26 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SPANXA1Q9NS26 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SPANXA1Q9NS26 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SPANXA1Q9NS26 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
SPANXA1Q9NS26 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SPANXA1Q9NS26 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SPANXA1Q9NS26 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SPANXA1Q9NS26 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SPANXA1Q9NS26 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SPANXA1Q9NS26 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SPANXA1Q9NS26 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SPANXA1Q9NS26 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SPANXA1Q9NS26 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SPANXA1Q9NS26 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SPANXA1Q9NS26 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SPANXA1Q9NS26 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SPANXA1Q9NS26 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SPANXA1Q9NS26 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SPANXA1Q9NS26 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
SPANXA1Q9NS26 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SPANXA1Q9NS26 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SPANXA1Q9NS26 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
SPANXA1Q9NS26 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SPANXA1Q9NS26 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SPANXA1Q9NS26 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SPANXA1Q9NS26 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SPANXA1Q9NS26 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SPANXA1Q9NS26 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPANXA1Q9NS26 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPANXA1Q9NS26 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPANXA1Q9NS26 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPANXA1Q9NS26 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPANXA1Q9NS26 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPANXA1Q9NS26 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPANXA1Q9NS26 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SPANXA1Q9NS26 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SPANXA1Q9NS26 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SPANXA1Q9NS26 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SPANXA1Q9NS26 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SPANXA1Q9NS26 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SPANXA1Q9NS26 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SPANXA1Q9NS26 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SPANXA1Q9NS26 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SPANXA1Q9NS26 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SPANXA1Q9NS26 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SPANXA1Q9NS26 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SPANXA1Q9NS26 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SPANXA1Q9NS26 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPANXA1Q9NS26 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPANXA1Q9NS26 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPANXA1Q9NS26 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPANXA1Q9NS26 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPANXA1Q9NS26 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPANXA1Q9NS26 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPANXA1Q9NS26 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPANXA1Q9NS26 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPANXA1Q9NS26 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPANXA1Q9NS26 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPANXA1Q9NS26 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPANXA1Q9NS26 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SPANXA1Q9NS26 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SPANXA1Q9NS26 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SPANXA1Q9NS26 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SPANXA1Q9NS26 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SPANXA1Q9NS26 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SPANXA1Q9NS26 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SPANXA1Q9NS26 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SPANXA1Q9NS26 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SPANXA1Q9NS26 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SPANXA1Q9NS26 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPANXA1Q9NS26 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPANXA1Q9NS26 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPANXA1Q9NS26 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPANXA1Q9NS26 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPANXA1Q9NS26 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPANXA1Q9NS26 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPANXA1Q9NS26 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPANXA1Q9NS26 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SPANXA1Q9NS26 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SPANXA1Q9NS26 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SPANXA1Q9NS26 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SPANXA1Q9NS26 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPANXA1Q9NS26 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPANXA1Q9NS26 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SPANXA1Q9NS26 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPANXA1Q9NS26 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SPANXA1Q9NS26 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPANXA1Q9NS26 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPANXA1Q9NS26 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SPANXA1Q9NS26 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SPANXA1Q9NS26 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SPANXA1Q9NS26 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPANXA1Q9NS26 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPANXA1Q9NS26 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
SPANXA1Q9NS26 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SPANXA1Q9NS26 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPANXA1Q9NS26 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPANXA1Q9NS26 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms