Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW7

VPS45, Vacuolar protein sorting-associated protein 45, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS45Q9NRW7 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
VPS45Q9NRW7 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
VPS45Q9NRW7 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
VPS45Q9NRW7 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
VPS45Q9NRW7 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
VPS45Q9NRW7 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
VPS45Q9NRW7 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
VPS45Q9NRW7 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
VPS45Q9NRW7 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
VPS45Q9NRW7 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
VPS45Q9NRW7 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
VPS45Q9NRW7 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
VPS45Q9NRW7 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
VPS45Q9NRW7 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
VPS45Q9NRW7 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
VPS45Q9NRW7 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
VPS45Q9NRW7 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
VPS45Q9NRW7 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
VPS45Q9NRW7 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
VPS45Q9NRW7 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
VPS45Q9NRW7 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
VPS45Q9NRW7 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
VPS45Q9NRW7 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
VPS45Q9NRW7 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
VPS45Q9NRW7 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
VPS45Q9NRW7 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
VPS45Q9NRW7 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
VPS45Q9NRW7 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
VPS45Q9NRW7 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
VPS45Q9NRW7 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
VPS45Q9NRW7 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
VPS45Q9NRW7 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
VPS45Q9NRW7 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
VPS45Q9NRW7 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
VPS45Q9NRW7 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
VPS45Q9NRW7 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
VPS45Q9NRW7 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
VPS45Q9NRW7 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
VPS45Q9NRW7 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
VPS45Q9NRW7 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
VPS45Q9NRW7 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
VPS45Q9NRW7 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
VPS45Q9NRW7 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
VPS45Q9NRW7 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
VPS45Q9NRW7 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
VPS45Q9NRW7 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
VPS45Q9NRW7 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
VPS45Q9NRW7 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
VPS45Q9NRW7 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
VPS45Q9NRW7 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
VPS45Q9NRW7 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
VPS45Q9NRW7 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
VPS45Q9NRW7 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
VPS45Q9NRW7 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
VPS45Q9NRW7 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
VPS45Q9NRW7 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
VPS45Q9NRW7 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
VPS45Q9NRW7 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
VPS45Q9NRW7 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
VPS45Q9NRW7 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
VPS45Q9NRW7 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
VPS45Q9NRW7 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
VPS45Q9NRW7 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
VPS45Q9NRW7 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
VPS45Q9NRW7 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
VPS45Q9NRW7 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
VPS45Q9NRW7 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
VPS45Q9NRW7 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
VPS45Q9NRW7 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
VPS45Q9NRW7 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
VPS45Q9NRW7 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
VPS45Q9NRW7 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
VPS45Q9NRW7 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
VPS45Q9NRW7 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
VPS45Q9NRW7 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
VPS45Q9NRW7 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
VPS45Q9NRW7 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
VPS45Q9NRW7 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
VPS45Q9NRW7 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
VPS45Q9NRW7 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
VPS45Q9NRW7 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
VPS45Q9NRW7 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
VPS45Q9NRW7 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
VPS45Q9NRW7 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
VPS45Q9NRW7 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
VPS45Q9NRW7 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
VPS45Q9NRW7 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
VPS45Q9NRW7 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
VPS45Q9NRW7 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
VPS45Q9NRW7 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
VPS45Q9NRW7 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
VPS45Q9NRW7 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
VPS45Q9NRW7 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
VPS45Q9NRW7 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
VPS45Q9NRW7 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
VPS45Q9NRW7 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
VPS45Q9NRW7 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
VPS45Q9NRW7 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
VPS45Q9NRW7 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
VPS45Q9NRW7 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.6 ms