Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR1

CYTL1, Cytokine-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTL1Q9NRR1 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYTL1Q9NRR1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYTL1Q9NRR1 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYTL1Q9NRR1 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYTL1Q9NRR1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYTL1Q9NRR1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYTL1Q9NRR1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYTL1Q9NRR1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYTL1Q9NRR1 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYTL1Q9NRR1 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYTL1Q9NRR1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYTL1Q9NRR1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYTL1Q9NRR1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYTL1Q9NRR1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CYTL1Q9NRR1 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CYTL1Q9NRR1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CYTL1Q9NRR1 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CYTL1Q9NRR1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYTL1Q9NRR1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYTL1Q9NRR1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYTL1Q9NRR1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CYTL1Q9NRR1 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYTL1Q9NRR1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYTL1Q9NRR1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYTL1Q9NRR1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYTL1Q9NRR1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYTL1Q9NRR1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CYTL1Q9NRR1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CYTL1Q9NRR1 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYTL1Q9NRR1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYTL1Q9NRR1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYTL1Q9NRR1 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYTL1Q9NRR1 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYTL1Q9NRR1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CYTL1Q9NRR1 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CYTL1Q9NRR1 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CYTL1Q9NRR1 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYTL1Q9NRR1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYTL1Q9NRR1 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CYTL1Q9NRR1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CYTL1Q9NRR1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CYTL1Q9NRR1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CYTL1Q9NRR1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CYTL1Q9NRR1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYTL1Q9NRR1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYTL1Q9NRR1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYTL1Q9NRR1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYTL1Q9NRR1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYTL1Q9NRR1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYTL1Q9NRR1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYTL1Q9NRR1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYTL1Q9NRR1 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CYTL1Q9NRR1 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CYTL1Q9NRR1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CYTL1Q9NRR1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CYTL1Q9NRR1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYTL1Q9NRR1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYTL1Q9NRR1 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYTL1Q9NRR1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYTL1Q9NRR1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYTL1Q9NRR1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYTL1Q9NRR1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CYTL1Q9NRR1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYTL1Q9NRR1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYTL1Q9NRR1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYTL1Q9NRR1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYTL1Q9NRR1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYTL1Q9NRR1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYTL1Q9NRR1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYTL1Q9NRR1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYTL1Q9NRR1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYTL1Q9NRR1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYTL1Q9NRR1 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYTL1Q9NRR1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYTL1Q9NRR1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CYTL1Q9NRR1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CYTL1Q9NRR1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CYTL1Q9NRR1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CYTL1Q9NRR1 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CYTL1Q9NRR1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CYTL1Q9NRR1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CYTL1Q9NRR1 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CYTL1Q9NRR1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CYTL1Q9NRR1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CYTL1Q9NRR1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CYTL1Q9NRR1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CYTL1Q9NRR1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYTL1Q9NRR1 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYTL1Q9NRR1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CYTL1Q9NRR1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CYTL1Q9NRR1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CYTL1Q9NRR1 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CYTL1Q9NRR1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CYTL1Q9NRR1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CYTL1Q9NRR1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CYTL1Q9NRR1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CYTL1Q9NRR1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CYTL1Q9NRR1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CYTL1Q9NRR1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYTL1Q9NRR1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms