Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ86

TRIM36, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM36, humanhuman

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM36Q9NQ86 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM36Q9NQ86 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM36Q9NQ86 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM36Q9NQ86 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM36Q9NQ86 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM36Q9NQ86 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM36Q9NQ86 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM36Q9NQ86 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM36Q9NQ86 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM36Q9NQ86 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM36Q9NQ86 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM36Q9NQ86 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM36Q9NQ86 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM36Q9NQ86 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM36Q9NQ86 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM36Q9NQ86 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM36Q9NQ86 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM36Q9NQ86 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM36Q9NQ86 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM36Q9NQ86 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM36Q9NQ86 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM36Q9NQ86 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM36Q9NQ86 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM36Q9NQ86 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRIM36Q9NQ86 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM36Q9NQ86 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM36Q9NQ86 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM36Q9NQ86 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM36Q9NQ86 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM36Q9NQ86 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM36Q9NQ86 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM36Q9NQ86 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM36Q9NQ86 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM36Q9NQ86 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM36Q9NQ86 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM36Q9NQ86 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM36Q9NQ86 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM36Q9NQ86 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM36Q9NQ86 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM36Q9NQ86 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM36Q9NQ86 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM36Q9NQ86 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM36Q9NQ86 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM36Q9NQ86 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM36Q9NQ86 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM36Q9NQ86 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM36Q9NQ86 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM36Q9NQ86 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM36Q9NQ86 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM36Q9NQ86 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM36Q9NQ86 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM36Q9NQ86 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM36Q9NQ86 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM36Q9NQ86 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM36Q9NQ86 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM36Q9NQ86 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM36Q9NQ86 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM36Q9NQ86 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM36Q9NQ86 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM36Q9NQ86 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM36Q9NQ86 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM36Q9NQ86 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM36Q9NQ86 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM36Q9NQ86 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM36Q9NQ86 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRIM36Q9NQ86 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM36Q9NQ86 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM36Q9NQ86 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM36Q9NQ86 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM36Q9NQ86 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM36Q9NQ86 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM36Q9NQ86 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM36Q9NQ86 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM36Q9NQ86 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM36Q9NQ86 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM36Q9NQ86 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM36Q9NQ86 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM36Q9NQ86 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM36Q9NQ86 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
TRIM36Q9NQ86 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM36Q9NQ86 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM36Q9NQ86 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM36Q9NQ86 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM36Q9NQ86 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM36Q9NQ86 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM36Q9NQ86 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM36Q9NQ86 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM36Q9NQ86 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM36Q9NQ86 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM36Q9NQ86 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM36Q9NQ86 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM36Q9NQ86 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM36Q9NQ86 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM36Q9NQ86 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM36Q9NQ86 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM36Q9NQ86 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM36Q9NQ86 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM36Q9NQ86 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM36Q9NQ86 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM36Q9NQ86 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms