Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
LHX9Q9NQ69 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
LHX9Q9NQ69 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LHX9Q9NQ69 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LHX9Q9NQ69 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LHX9Q9NQ69 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LHX9Q9NQ69 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LHX9Q9NQ69 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LHX9Q9NQ69 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
LHX9Q9NQ69 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LHX9Q9NQ69 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LHX9Q9NQ69 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LHX9Q9NQ69 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LHX9Q9NQ69 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LHX9Q9NQ69 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LHX9Q9NQ69 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LHX9Q9NQ69 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LHX9Q9NQ69 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LHX9Q9NQ69 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LHX9Q9NQ69 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LHX9Q9NQ69 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LHX9Q9NQ69 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LHX9Q9NQ69 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LHX9Q9NQ69 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LHX9Q9NQ69 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LHX9Q9NQ69 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LHX9Q9NQ69 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LHX9Q9NQ69 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LHX9Q9NQ69 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LHX9Q9NQ69 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
LHX9Q9NQ69 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
LHX9Q9NQ69 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
LHX9Q9NQ69 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LHX9Q9NQ69 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LHX9Q9NQ69 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LHX9Q9NQ69 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LHX9Q9NQ69 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LHX9Q9NQ69 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LHX9Q9NQ69 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LHX9Q9NQ69 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LHX9Q9NQ69 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LHX9Q9NQ69 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LHX9Q9NQ69 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LHX9Q9NQ69 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LHX9Q9NQ69 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LHX9Q9NQ69 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LHX9Q9NQ69 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LHX9Q9NQ69 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LHX9Q9NQ69 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LHX9Q9NQ69 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LHX9Q9NQ69 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LHX9Q9NQ69 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LHX9Q9NQ69 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LHX9Q9NQ69 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LHX9Q9NQ69 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LHX9Q9NQ69 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LHX9Q9NQ69 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LHX9Q9NQ69 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LHX9Q9NQ69 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LHX9Q9NQ69 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LHX9Q9NQ69 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LHX9Q9NQ69 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LHX9Q9NQ69 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LHX9Q9NQ69 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LHX9Q9NQ69 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LHX9Q9NQ69 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
LHX9Q9NQ69 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LHX9Q9NQ69 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
LHX9Q9NQ69 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LHX9Q9NQ69 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LHX9Q9NQ69 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
LHX9Q9NQ69 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LHX9Q9NQ69 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LHX9Q9NQ69 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LHX9Q9NQ69 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LHX9Q9NQ69 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LHX9Q9NQ69 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LHX9Q9NQ69 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LHX9Q9NQ69 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LHX9Q9NQ69 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LHX9Q9NQ69 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LHX9Q9NQ69 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
LHX9Q9NQ69 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LHX9Q9NQ69 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
LHX9Q9NQ69 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LHX9Q9NQ69 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LHX9Q9NQ69 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LHX9Q9NQ69 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LHX9Q9NQ69 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LHX9Q9NQ69 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LHX9Q9NQ69 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LHX9Q9NQ69 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LHX9Q9NQ69 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LHX9Q9NQ69 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LHX9Q9NQ69 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LHX9Q9NQ69 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LHX9Q9NQ69 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LHX9Q9NQ69 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LHX9Q9NQ69 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LHX9Q9NQ69 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms