Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FANCFQ9NPI8 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FANCFQ9NPI8 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FANCFQ9NPI8 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FANCFQ9NPI8 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FANCFQ9NPI8 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FANCFQ9NPI8 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FANCFQ9NPI8 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FANCFQ9NPI8 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FANCFQ9NPI8 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FANCFQ9NPI8 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FANCFQ9NPI8 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FANCFQ9NPI8 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FANCFQ9NPI8 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FANCFQ9NPI8 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FANCFQ9NPI8 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
FANCFQ9NPI8 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FANCFQ9NPI8 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FANCFQ9NPI8 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FANCFQ9NPI8 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FANCFQ9NPI8 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FANCFQ9NPI8 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FANCFQ9NPI8 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
FANCFQ9NPI8 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
FANCFQ9NPI8 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FANCFQ9NPI8 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FANCFQ9NPI8 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FANCFQ9NPI8 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FANCFQ9NPI8 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FANCFQ9NPI8 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FANCFQ9NPI8 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FANCFQ9NPI8 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FANCFQ9NPI8 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FANCFQ9NPI8 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FANCFQ9NPI8 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FANCFQ9NPI8 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FANCFQ9NPI8 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FANCFQ9NPI8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FANCFQ9NPI8 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FANCFQ9NPI8 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FANCFQ9NPI8 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FANCFQ9NPI8 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FANCFQ9NPI8 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FANCFQ9NPI8 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FANCFQ9NPI8 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FANCFQ9NPI8 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FANCFQ9NPI8 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FANCFQ9NPI8 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FANCFQ9NPI8 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FANCFQ9NPI8 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FANCFQ9NPI8 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FANCFQ9NPI8 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FANCFQ9NPI8 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FANCFQ9NPI8 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FANCFQ9NPI8 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
FANCFQ9NPI8 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FANCFQ9NPI8 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FANCFQ9NPI8 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FANCFQ9NPI8 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FANCFQ9NPI8 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FANCFQ9NPI8 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FANCFQ9NPI8 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FANCFQ9NPI8 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FANCFQ9NPI8 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FANCFQ9NPI8 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FANCFQ9NPI8 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FANCFQ9NPI8 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FANCFQ9NPI8 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FANCFQ9NPI8 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
FANCFQ9NPI8 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FANCFQ9NPI8 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FANCFQ9NPI8 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FANCFQ9NPI8 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FANCFQ9NPI8 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
FANCFQ9NPI8 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
FANCFQ9NPI8 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
FANCFQ9NPI8 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FANCFQ9NPI8 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FANCFQ9NPI8 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FANCFQ9NPI8 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FANCFQ9NPI8 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FANCFQ9NPI8 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FANCFQ9NPI8 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FANCFQ9NPI8 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FANCFQ9NPI8 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FANCFQ9NPI8 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FANCFQ9NPI8 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FANCFQ9NPI8 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FANCFQ9NPI8 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FANCFQ9NPI8 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FANCFQ9NPI8 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FANCFQ9NPI8 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FANCFQ9NPI8 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FANCFQ9NPI8 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FANCFQ9NPI8 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FANCFQ9NPI8 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FANCFQ9NPI8 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FANCFQ9NPI8 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FANCFQ9NPI8 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FANCFQ9NPI8 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms