Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP78

ABCB9, ATP-binding cassette sub-family B member 9, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB9Q9NP78 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ABCB9Q9NP78 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ABCB9Q9NP78 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ABCB9Q9NP78 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ABCB9Q9NP78 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ABCB9Q9NP78 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ABCB9Q9NP78 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ABCB9Q9NP78 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ABCB9Q9NP78 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ABCB9Q9NP78 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ABCB9Q9NP78 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ABCB9Q9NP78 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ABCB9Q9NP78 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ABCB9Q9NP78 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ABCB9Q9NP78 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ABCB9Q9NP78 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ABCB9Q9NP78 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ABCB9Q9NP78 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ABCB9Q9NP78 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ABCB9Q9NP78 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ABCB9Q9NP78 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ABCB9Q9NP78 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ABCB9Q9NP78 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ABCB9Q9NP78 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
ABCB9Q9NP78 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ABCB9Q9NP78 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ABCB9Q9NP78 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ABCB9Q9NP78 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ABCB9Q9NP78 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ABCB9Q9NP78 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ABCB9Q9NP78 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ABCB9Q9NP78 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ABCB9Q9NP78 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ABCB9Q9NP78 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ABCB9Q9NP78 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ABCB9Q9NP78 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ABCB9Q9NP78 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ABCB9Q9NP78 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ABCB9Q9NP78 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ABCB9Q9NP78 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ABCB9Q9NP78 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ABCB9Q9NP78 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ABCB9Q9NP78 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ABCB9Q9NP78 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ABCB9Q9NP78 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ABCB9Q9NP78 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ABCB9Q9NP78 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ABCB9Q9NP78 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ABCB9Q9NP78 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ABCB9Q9NP78 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ABCB9Q9NP78 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ABCB9Q9NP78 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ABCB9Q9NP78 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ABCB9Q9NP78 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ABCB9Q9NP78 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ABCB9Q9NP78 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ABCB9Q9NP78 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ABCB9Q9NP78 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ABCB9Q9NP78 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ABCB9Q9NP78 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ABCB9Q9NP78 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ABCB9Q9NP78 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ABCB9Q9NP78 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ABCB9Q9NP78 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ABCB9Q9NP78 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ABCB9Q9NP78 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ABCB9Q9NP78 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ABCB9Q9NP78 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ABCB9Q9NP78 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ABCB9Q9NP78 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ABCB9Q9NP78 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ABCB9Q9NP78 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ABCB9Q9NP78 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ABCB9Q9NP78 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ABCB9Q9NP78 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ABCB9Q9NP78 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ABCB9Q9NP78 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ABCB9Q9NP78 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ABCB9Q9NP78 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ABCB9Q9NP78 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ABCB9Q9NP78 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ABCB9Q9NP78 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ABCB9Q9NP78 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ABCB9Q9NP78 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ABCB9Q9NP78 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ABCB9Q9NP78 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ABCB9Q9NP78 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ABCB9Q9NP78 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ABCB9Q9NP78 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ABCB9Q9NP78 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ABCB9Q9NP78 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ABCB9Q9NP78 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ABCB9Q9NP78 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ABCB9Q9NP78 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ABCB9Q9NP78 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ABCB9Q9NP78 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ABCB9Q9NP78 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ABCB9Q9NP78 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ABCB9Q9NP78 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ABCB9Q9NP78 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms