Protein–RNA interactions for Protein: Q9H902

REEP1, Receptor expression-enhancing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP1Q9H902 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
REEP1Q9H902 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
REEP1Q9H902 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
REEP1Q9H902 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
REEP1Q9H902 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
REEP1Q9H902 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
REEP1Q9H902 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
REEP1Q9H902 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
REEP1Q9H902 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
REEP1Q9H902 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
REEP1Q9H902 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
REEP1Q9H902 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
REEP1Q9H902 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
REEP1Q9H902 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
REEP1Q9H902 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
REEP1Q9H902 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
REEP1Q9H902 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
REEP1Q9H902 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
REEP1Q9H902 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
REEP1Q9H902 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
REEP1Q9H902 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
REEP1Q9H902 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
REEP1Q9H902 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
REEP1Q9H902 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
REEP1Q9H902 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
REEP1Q9H902 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
REEP1Q9H902 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
REEP1Q9H902 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
REEP1Q9H902 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
REEP1Q9H902 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
REEP1Q9H902 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
REEP1Q9H902 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
REEP1Q9H902 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.68
REEP1Q9H902 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
REEP1Q9H902 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
REEP1Q9H902 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
REEP1Q9H902 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
REEP1Q9H902 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
REEP1Q9H902 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
REEP1Q9H902 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
REEP1Q9H902 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
REEP1Q9H902 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
REEP1Q9H902 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
REEP1Q9H902 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
REEP1Q9H902 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
REEP1Q9H902 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
REEP1Q9H902 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
REEP1Q9H902 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
REEP1Q9H902 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
REEP1Q9H902 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
REEP1Q9H902 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
REEP1Q9H902 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
REEP1Q9H902 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
REEP1Q9H902 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
REEP1Q9H902 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
REEP1Q9H902 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
REEP1Q9H902 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
REEP1Q9H902 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
REEP1Q9H902 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
REEP1Q9H902 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
REEP1Q9H902 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
REEP1Q9H902 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
REEP1Q9H902 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
REEP1Q9H902 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
REEP1Q9H902 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
REEP1Q9H902 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
REEP1Q9H902 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
REEP1Q9H902 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
REEP1Q9H902 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
REEP1Q9H902 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
REEP1Q9H902 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
REEP1Q9H902 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
REEP1Q9H902 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
REEP1Q9H902 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
REEP1Q9H902 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
REEP1Q9H902 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
REEP1Q9H902 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
REEP1Q9H902 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
REEP1Q9H902 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
REEP1Q9H902 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
REEP1Q9H902 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
REEP1Q9H902 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
REEP1Q9H902 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
REEP1Q9H902 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
REEP1Q9H902 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
REEP1Q9H902 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
REEP1Q9H902 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
REEP1Q9H902 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
REEP1Q9H902 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
REEP1Q9H902 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
REEP1Q9H902 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
REEP1Q9H902 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
REEP1Q9H902 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
REEP1Q9H902 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
REEP1Q9H902 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
REEP1Q9H902 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
REEP1Q9H902 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
REEP1Q9H902 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
REEP1Q9H902 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
REEP1Q9H902 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms