Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2S1

KCNN2, Small conductance calcium-activated potassium channel protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNN2Q9H2S1 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
KCNN2Q9H2S1 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KCNN2Q9H2S1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KCNN2Q9H2S1 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KCNN2Q9H2S1 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KCNN2Q9H2S1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KCNN2Q9H2S1 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KCNN2Q9H2S1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KCNN2Q9H2S1 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KCNN2Q9H2S1 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KCNN2Q9H2S1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
KCNN2Q9H2S1 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KCNN2Q9H2S1 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KCNN2Q9H2S1 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KCNN2Q9H2S1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KCNN2Q9H2S1 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KCNN2Q9H2S1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KCNN2Q9H2S1 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KCNN2Q9H2S1 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KCNN2Q9H2S1 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KCNN2Q9H2S1 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KCNN2Q9H2S1 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KCNN2Q9H2S1 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KCNN2Q9H2S1 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KCNN2Q9H2S1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KCNN2Q9H2S1 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KCNN2Q9H2S1 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KCNN2Q9H2S1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KCNN2Q9H2S1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KCNN2Q9H2S1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KCNN2Q9H2S1 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
KCNN2Q9H2S1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KCNN2Q9H2S1 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KCNN2Q9H2S1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KCNN2Q9H2S1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KCNN2Q9H2S1 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KCNN2Q9H2S1 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KCNN2Q9H2S1 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KCNN2Q9H2S1 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
KCNN2Q9H2S1 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KCNN2Q9H2S1 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KCNN2Q9H2S1 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KCNN2Q9H2S1 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KCNN2Q9H2S1 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KCNN2Q9H2S1 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KCNN2Q9H2S1 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KCNN2Q9H2S1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KCNN2Q9H2S1 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KCNN2Q9H2S1 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KCNN2Q9H2S1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KCNN2Q9H2S1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KCNN2Q9H2S1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KCNN2Q9H2S1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KCNN2Q9H2S1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KCNN2Q9H2S1 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KCNN2Q9H2S1 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KCNN2Q9H2S1 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KCNN2Q9H2S1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KCNN2Q9H2S1 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KCNN2Q9H2S1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KCNN2Q9H2S1 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KCNN2Q9H2S1 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KCNN2Q9H2S1 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KCNN2Q9H2S1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KCNN2Q9H2S1 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KCNN2Q9H2S1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KCNN2Q9H2S1 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KCNN2Q9H2S1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KCNN2Q9H2S1 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KCNN2Q9H2S1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KCNN2Q9H2S1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KCNN2Q9H2S1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KCNN2Q9H2S1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KCNN2Q9H2S1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KCNN2Q9H2S1 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KCNN2Q9H2S1 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KCNN2Q9H2S1 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
KCNN2Q9H2S1 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KCNN2Q9H2S1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KCNN2Q9H2S1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KCNN2Q9H2S1 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KCNN2Q9H2S1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KCNN2Q9H2S1 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KCNN2Q9H2S1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KCNN2Q9H2S1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KCNN2Q9H2S1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KCNN2Q9H2S1 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNN2Q9H2S1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNN2Q9H2S1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNN2Q9H2S1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNN2Q9H2S1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNN2Q9H2S1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNN2Q9H2S1 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNN2Q9H2S1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNN2Q9H2S1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNN2Q9H2S1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCNN2Q9H2S1 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNN2Q9H2S1 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNN2Q9H2S1 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNN2Q9H2S1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms