Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0G0

ZNF407, Zinc finger protein 407, humanhuman

Predictions only

Length 2,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF407Q9C0G0 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF407Q9C0G0 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF407Q9C0G0 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF407Q9C0G0 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF407Q9C0G0 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF407Q9C0G0 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF407Q9C0G0 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF407Q9C0G0 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF407Q9C0G0 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF407Q9C0G0 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF407Q9C0G0 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF407Q9C0G0 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF407Q9C0G0 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF407Q9C0G0 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF407Q9C0G0 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF407Q9C0G0 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF407Q9C0G0 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZNF407Q9C0G0 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZNF407Q9C0G0 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZNF407Q9C0G0 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZNF407Q9C0G0 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
ZNF407Q9C0G0 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ZNF407Q9C0G0 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
ZNF407Q9C0G0 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ZNF407Q9C0G0 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZNF407Q9C0G0 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZNF407Q9C0G0 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZNF407Q9C0G0 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZNF407Q9C0G0 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNF407Q9C0G0 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNF407Q9C0G0 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF407Q9C0G0 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF407Q9C0G0 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF407Q9C0G0 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF407Q9C0G0 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF407Q9C0G0 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF407Q9C0G0 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF407Q9C0G0 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF407Q9C0G0 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNF407Q9C0G0 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF407Q9C0G0 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF407Q9C0G0 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF407Q9C0G0 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF407Q9C0G0 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF407Q9C0G0 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF407Q9C0G0 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF407Q9C0G0 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF407Q9C0G0 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF407Q9C0G0 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF407Q9C0G0 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF407Q9C0G0 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF407Q9C0G0 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF407Q9C0G0 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF407Q9C0G0 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF407Q9C0G0 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF407Q9C0G0 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF407Q9C0G0 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF407Q9C0G0 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF407Q9C0G0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF407Q9C0G0 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF407Q9C0G0 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF407Q9C0G0 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF407Q9C0G0 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF407Q9C0G0 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF407Q9C0G0 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNF407Q9C0G0 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNF407Q9C0G0 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNF407Q9C0G0 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNF407Q9C0G0 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF407Q9C0G0 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNF407Q9C0G0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNF407Q9C0G0 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF407Q9C0G0 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF407Q9C0G0 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF407Q9C0G0 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF407Q9C0G0 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF407Q9C0G0 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF407Q9C0G0 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF407Q9C0G0 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF407Q9C0G0 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF407Q9C0G0 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF407Q9C0G0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF407Q9C0G0 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF407Q9C0G0 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF407Q9C0G0 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF407Q9C0G0 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF407Q9C0G0 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF407Q9C0G0 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF407Q9C0G0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF407Q9C0G0 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF407Q9C0G0 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF407Q9C0G0 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF407Q9C0G0 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF407Q9C0G0 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF407Q9C0G0 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF407Q9C0G0 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF407Q9C0G0 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF407Q9C0G0 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF407Q9C0G0 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF407Q9C0G0 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms