Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
SRRTQ9BXP5 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
SRRTQ9BXP5 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
SRRTQ9BXP5 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC30.75■■■□□ 2.51
SRRTQ9BXP5 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
SRRTQ9BXP5 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
SRRTQ9BXP5 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
SRRTQ9BXP5 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC30.74■■■□□ 2.51
SRRTQ9BXP5 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
SRRTQ9BXP5 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
SRRTQ9BXP5 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
SRRTQ9BXP5 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
SRRTQ9BXP5 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
SRRTQ9BXP5 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC30.71■■■□□ 2.51
SRRTQ9BXP5 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
SRRTQ9BXP5 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
SRRTQ9BXP5 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
SRRTQ9BXP5 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
SRRTQ9BXP5 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
SRRTQ9BXP5 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
SRRTQ9BXP5 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
SRRTQ9BXP5 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC30.65■■■□□ 2.5
SRRTQ9BXP5 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
SRRTQ9BXP5 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC30.65■■■□□ 2.5
SRRTQ9BXP5 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
SRRTQ9BXP5 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
SRRTQ9BXP5 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
SRRTQ9BXP5 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
SRRTQ9BXP5 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC30.61■■■□□ 2.49
SRRTQ9BXP5 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
SRRTQ9BXP5 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
SRRTQ9BXP5 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
SRRTQ9BXP5 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC30.58■■■□□ 2.49
SRRTQ9BXP5 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
SRRTQ9BXP5 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
SRRTQ9BXP5 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
SRRTQ9BXP5 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
SRRTQ9BXP5 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
SRRTQ9BXP5 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SRRTQ9BXP5 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
SRRTQ9BXP5 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
SRRTQ9BXP5 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
SRRTQ9BXP5 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
SRRTQ9BXP5 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SRRTQ9BXP5 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SRRTQ9BXP5 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
SRRTQ9BXP5 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
SRRTQ9BXP5 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
SRRTQ9BXP5 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SRRTQ9BXP5 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.47
SRRTQ9BXP5 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
SRRTQ9BXP5 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
SRRTQ9BXP5 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
SRRTQ9BXP5 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
SRRTQ9BXP5 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
SRRTQ9BXP5 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
SRRTQ9BXP5 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
SRRTQ9BXP5 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
SRRTQ9BXP5 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
SRRTQ9BXP5 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
SRRTQ9BXP5 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
SRRTQ9BXP5 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
SRRTQ9BXP5 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
SRRTQ9BXP5 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
SRRTQ9BXP5 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
SRRTQ9BXP5 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
SRRTQ9BXP5 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
SRRTQ9BXP5 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
SRRTQ9BXP5 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
SRRTQ9BXP5 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
SRRTQ9BXP5 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
SRRTQ9BXP5 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
SRRTQ9BXP5 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
SRRTQ9BXP5 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
SRRTQ9BXP5 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
SRRTQ9BXP5 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
SRRTQ9BXP5 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
SRRTQ9BXP5 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
SRRTQ9BXP5 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
SRRTQ9BXP5 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
SRRTQ9BXP5 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
SRRTQ9BXP5 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
SRRTQ9BXP5 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
SRRTQ9BXP5 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
SRRTQ9BXP5 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SRRTQ9BXP5 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SRRTQ9BXP5 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SRRTQ9BXP5 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SRRTQ9BXP5 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SRRTQ9BXP5 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
SRRTQ9BXP5 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SRRTQ9BXP5 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SRRTQ9BXP5 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SRRTQ9BXP5 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SRRTQ9BXP5 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SRRTQ9BXP5 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SRRTQ9BXP5 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SRRTQ9BXP5 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SRRTQ9BXP5 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SRRTQ9BXP5 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms