Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL4

SELENOO, Selenoprotein O, humanhuman

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENOOQ9BVL4 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SELENOOQ9BVL4 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SELENOOQ9BVL4 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SELENOOQ9BVL4 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SELENOOQ9BVL4 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SELENOOQ9BVL4 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SELENOOQ9BVL4 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SELENOOQ9BVL4 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SELENOOQ9BVL4 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
SELENOOQ9BVL4 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
SELENOOQ9BVL4 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
SELENOOQ9BVL4 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SELENOOQ9BVL4 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SELENOOQ9BVL4 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SELENOOQ9BVL4 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SELENOOQ9BVL4 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SELENOOQ9BVL4 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SELENOOQ9BVL4 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SELENOOQ9BVL4 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SELENOOQ9BVL4 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
SELENOOQ9BVL4 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SELENOOQ9BVL4 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SELENOOQ9BVL4 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SELENOOQ9BVL4 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SELENOOQ9BVL4 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SELENOOQ9BVL4 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SELENOOQ9BVL4 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
SELENOOQ9BVL4 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SELENOOQ9BVL4 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SELENOOQ9BVL4 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SELENOOQ9BVL4 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SELENOOQ9BVL4 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SELENOOQ9BVL4 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SELENOOQ9BVL4 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SELENOOQ9BVL4 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SELENOOQ9BVL4 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SELENOOQ9BVL4 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SELENOOQ9BVL4 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SELENOOQ9BVL4 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SELENOOQ9BVL4 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SELENOOQ9BVL4 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SELENOOQ9BVL4 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SELENOOQ9BVL4 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SELENOOQ9BVL4 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SELENOOQ9BVL4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SELENOOQ9BVL4 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SELENOOQ9BVL4 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SELENOOQ9BVL4 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SELENOOQ9BVL4 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SELENOOQ9BVL4 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
SELENOOQ9BVL4 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SELENOOQ9BVL4 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
SELENOOQ9BVL4 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SELENOOQ9BVL4 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SELENOOQ9BVL4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SELENOOQ9BVL4 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SELENOOQ9BVL4 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SELENOOQ9BVL4 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SELENOOQ9BVL4 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SELENOOQ9BVL4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SELENOOQ9BVL4 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SELENOOQ9BVL4 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SELENOOQ9BVL4 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SELENOOQ9BVL4 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SELENOOQ9BVL4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SELENOOQ9BVL4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SELENOOQ9BVL4 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SELENOOQ9BVL4 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SELENOOQ9BVL4 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SELENOOQ9BVL4 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SELENOOQ9BVL4 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SELENOOQ9BVL4 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SELENOOQ9BVL4 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SELENOOQ9BVL4 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SELENOOQ9BVL4 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SELENOOQ9BVL4 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SELENOOQ9BVL4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SELENOOQ9BVL4 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SELENOOQ9BVL4 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SELENOOQ9BVL4 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SELENOOQ9BVL4 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SELENOOQ9BVL4 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.27
SELENOOQ9BVL4 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SELENOOQ9BVL4 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SELENOOQ9BVL4 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SELENOOQ9BVL4 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SELENOOQ9BVL4 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SELENOOQ9BVL4 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SELENOOQ9BVL4 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SELENOOQ9BVL4 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SELENOOQ9BVL4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SELENOOQ9BVL4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SELENOOQ9BVL4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SELENOOQ9BVL4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SELENOOQ9BVL4 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SELENOOQ9BVL4 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SELENOOQ9BVL4 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SELENOOQ9BVL4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SELENOOQ9BVL4 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SELENOOQ9BVL4 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms