Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV29

CCDC32, Coiled-coil domain-containing protein 32, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC32Q9BV29 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC32Q9BV29 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC32Q9BV29 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC32Q9BV29 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC32Q9BV29 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC32Q9BV29 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC32Q9BV29 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC32Q9BV29 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC32Q9BV29 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC32Q9BV29 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC32Q9BV29 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC32Q9BV29 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC32Q9BV29 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC32Q9BV29 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC32Q9BV29 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC32Q9BV29 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC32Q9BV29 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC32Q9BV29 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC32Q9BV29 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC32Q9BV29 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC32Q9BV29 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC32Q9BV29 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC32Q9BV29 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC32Q9BV29 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC32Q9BV29 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC32Q9BV29 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC32Q9BV29 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC32Q9BV29 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC32Q9BV29 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC32Q9BV29 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC32Q9BV29 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC32Q9BV29 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC32Q9BV29 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC32Q9BV29 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC32Q9BV29 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC32Q9BV29 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC32Q9BV29 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC32Q9BV29 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC32Q9BV29 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC32Q9BV29 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC32Q9BV29 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC32Q9BV29 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC32Q9BV29 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC32Q9BV29 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC32Q9BV29 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC32Q9BV29 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC32Q9BV29 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC32Q9BV29 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC32Q9BV29 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC32Q9BV29 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC32Q9BV29 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC32Q9BV29 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC32Q9BV29 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC32Q9BV29 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC32Q9BV29 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC32Q9BV29 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC32Q9BV29 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC32Q9BV29 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC32Q9BV29 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC32Q9BV29 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC32Q9BV29 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC32Q9BV29 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC32Q9BV29 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC32Q9BV29 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC32Q9BV29 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC32Q9BV29 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC32Q9BV29 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC32Q9BV29 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC32Q9BV29 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC32Q9BV29 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC32Q9BV29 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC32Q9BV29 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC32Q9BV29 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC32Q9BV29 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC32Q9BV29 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC32Q9BV29 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC32Q9BV29 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC32Q9BV29 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC32Q9BV29 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC32Q9BV29 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC32Q9BV29 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC32Q9BV29 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC32Q9BV29 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC32Q9BV29 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC32Q9BV29 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC32Q9BV29 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC32Q9BV29 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC32Q9BV29 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC32Q9BV29 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC32Q9BV29 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC32Q9BV29 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC32Q9BV29 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC32Q9BV29 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC32Q9BV29 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC32Q9BV29 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC32Q9BV29 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC32Q9BV29 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC32Q9BV29 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC32Q9BV29 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC32Q9BV29 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms