Protein–RNA interactions for Protein: Q99471

PFDN5, Prefoldin subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN5Q99471 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PFDN5Q99471 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PFDN5Q99471 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PFDN5Q99471 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PFDN5Q99471 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PFDN5Q99471 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PFDN5Q99471 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PFDN5Q99471 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PFDN5Q99471 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PFDN5Q99471 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PFDN5Q99471 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PFDN5Q99471 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PFDN5Q99471 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PFDN5Q99471 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PFDN5Q99471 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PFDN5Q99471 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PFDN5Q99471 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PFDN5Q99471 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PFDN5Q99471 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PFDN5Q99471 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PFDN5Q99471 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PFDN5Q99471 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PFDN5Q99471 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PFDN5Q99471 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PFDN5Q99471 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PFDN5Q99471 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PFDN5Q99471 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PFDN5Q99471 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PFDN5Q99471 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PFDN5Q99471 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PFDN5Q99471 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PFDN5Q99471 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PFDN5Q99471 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PFDN5Q99471 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PFDN5Q99471 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PFDN5Q99471 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PFDN5Q99471 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PFDN5Q99471 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PFDN5Q99471 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PFDN5Q99471 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PFDN5Q99471 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
PFDN5Q99471 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PFDN5Q99471 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PFDN5Q99471 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PFDN5Q99471 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PFDN5Q99471 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PFDN5Q99471 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PFDN5Q99471 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PFDN5Q99471 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PFDN5Q99471 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PFDN5Q99471 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PFDN5Q99471 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PFDN5Q99471 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PFDN5Q99471 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PFDN5Q99471 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PFDN5Q99471 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PFDN5Q99471 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PFDN5Q99471 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PFDN5Q99471 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PFDN5Q99471 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PFDN5Q99471 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PFDN5Q99471 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PFDN5Q99471 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PFDN5Q99471 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PFDN5Q99471 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PFDN5Q99471 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PFDN5Q99471 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PFDN5Q99471 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PFDN5Q99471 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PFDN5Q99471 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PFDN5Q99471 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PFDN5Q99471 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PFDN5Q99471 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PFDN5Q99471 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PFDN5Q99471 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PFDN5Q99471 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PFDN5Q99471 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PFDN5Q99471 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PFDN5Q99471 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PFDN5Q99471 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PFDN5Q99471 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PFDN5Q99471 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PFDN5Q99471 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PFDN5Q99471 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PFDN5Q99471 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PFDN5Q99471 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PFDN5Q99471 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PFDN5Q99471 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PFDN5Q99471 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PFDN5Q99471 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PFDN5Q99471 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PFDN5Q99471 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PFDN5Q99471 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PFDN5Q99471 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PFDN5Q99471 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PFDN5Q99471 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PFDN5Q99471 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PFDN5Q99471 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PFDN5Q99471 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PFDN5Q99471 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms