Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q04

LMTK3, Serine/threonine-protein kinase LMTK3, humanhuman

Predictions only

Length 1,460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMTK3Q96Q04 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.29■■■■■ 4.36
LMTK3Q96Q04 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC42.25■■■■■ 4.35
LMTK3Q96Q04 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC42.24■■■■■ 4.35
LMTK3Q96Q04 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC42.23■■■■■ 4.35
LMTK3Q96Q04 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC42.23■■■■■ 4.35
LMTK3Q96Q04 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.23■■■■■ 4.35
LMTK3Q96Q04 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.23■■■■■ 4.35
LMTK3Q96Q04 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.23■■■■■ 4.35
LMTK3Q96Q04 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC42.22■■■■■ 4.35
LMTK3Q96Q04 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC42.2■■■■■ 4.35
LMTK3Q96Q04 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC42.17■■■■■ 4.34
LMTK3Q96Q04 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC42.17■■■■■ 4.34
LMTK3Q96Q04 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC42.14■■■■■ 4.34
LMTK3Q96Q04 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC42.13■■■■■ 4.34
LMTK3Q96Q04 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC42.13■■■■■ 4.34
LMTK3Q96Q04 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC42.13■■■■■ 4.34
LMTK3Q96Q04 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.12■■■■■ 4.33
LMTK3Q96Q04 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC42.1■■■■■ 4.33
LMTK3Q96Q04 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.03■■■■■ 4.32
LMTK3Q96Q04 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
LMTK3Q96Q04 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.02■■■■■ 4.32
LMTK3Q96Q04 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC42■■■■■ 4.31
LMTK3Q96Q04 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC41.99■■■■■ 4.31
LMTK3Q96Q04 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
LMTK3Q96Q04 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC41.97■■■■■ 4.31
LMTK3Q96Q04 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC41.96■■■■■ 4.31
LMTK3Q96Q04 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC41.95■■■■■ 4.31
LMTK3Q96Q04 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC41.95■■■■■ 4.31
LMTK3Q96Q04 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC41.92■■■■■ 4.3
LMTK3Q96Q04 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC41.92■■■■■ 4.3
LMTK3Q96Q04 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC41.92■■■■■ 4.3
LMTK3Q96Q04 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
LMTK3Q96Q04 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.82■■■■■ 4.29
LMTK3Q96Q04 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC41.81■■■■■ 4.28
LMTK3Q96Q04 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.8■■■■■ 4.28
LMTK3Q96Q04 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.79■■■■■ 4.28
LMTK3Q96Q04 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
LMTK3Q96Q04 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.75■■■■■ 4.27
LMTK3Q96Q04 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.75■■■■■ 4.27
LMTK3Q96Q04 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC41.74■■■■■ 4.27
LMTK3Q96Q04 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC41.72■■■■■ 4.27
LMTK3Q96Q04 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC41.72■■■■■ 4.27
LMTK3Q96Q04 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.69■■■■■ 4.26
LMTK3Q96Q04 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.68■■■■■ 4.26
LMTK3Q96Q04 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC41.67■■■■■ 4.26
LMTK3Q96Q04 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC41.63■■■■■ 4.25
LMTK3Q96Q04 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC41.63■■■■■ 4.25
LMTK3Q96Q04 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC41.63■■■■■ 4.25
LMTK3Q96Q04 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
LMTK3Q96Q04 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC41.6■■■■■ 4.25
LMTK3Q96Q04 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC41.59■■■■■ 4.25
LMTK3Q96Q04 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC41.59■■■■■ 4.25
LMTK3Q96Q04 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
LMTK3Q96Q04 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC41.58■■■■■ 4.25
LMTK3Q96Q04 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.57■■■■■ 4.25
LMTK3Q96Q04 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC41.57■■■■■ 4.25
LMTK3Q96Q04 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.54■■■■■ 4.24
LMTK3Q96Q04 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
LMTK3Q96Q04 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC41.53■■■■■ 4.24
LMTK3Q96Q04 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC41.53■■■■■ 4.24
LMTK3Q96Q04 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC41.53■■■■■ 4.24
LMTK3Q96Q04 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC41.53■■■■■ 4.24
LMTK3Q96Q04 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.51■■■■■ 4.24
LMTK3Q96Q04 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.48■■■■■ 4.23
LMTK3Q96Q04 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
LMTK3Q96Q04 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC41.46■■■■■ 4.23
LMTK3Q96Q04 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC41.43■■■■■ 4.22
LMTK3Q96Q04 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC41.41■■■■■ 4.22
LMTK3Q96Q04 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
LMTK3Q96Q04 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
LMTK3Q96Q04 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
LMTK3Q96Q04 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC41.35■■■■■ 4.21
LMTK3Q96Q04 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC41.35■■■■■ 4.21
LMTK3Q96Q04 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC41.34■■■■■ 4.21
LMTK3Q96Q04 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC41.34■■■■■ 4.21
LMTK3Q96Q04 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
LMTK3Q96Q04 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC41.3■■■■■ 4.2
LMTK3Q96Q04 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
LMTK3Q96Q04 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
LMTK3Q96Q04 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
LMTK3Q96Q04 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
LMTK3Q96Q04 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC41.22■■■■■ 4.19
LMTK3Q96Q04 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC41.22■■■■■ 4.19
LMTK3Q96Q04 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC41.21■■■■■ 4.19
LMTK3Q96Q04 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.21■■■■■ 4.19
LMTK3Q96Q04 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC41.15■■■■■ 4.18
LMTK3Q96Q04 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
LMTK3Q96Q04 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.11■■■■■ 4.17
LMTK3Q96Q04 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.08■■■■■ 4.17
LMTK3Q96Q04 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.16
LMTK3Q96Q04 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
LMTK3Q96Q04 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC41.05■■■■■ 4.16
LMTK3Q96Q04 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC41.05■■■■■ 4.16
LMTK3Q96Q04 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
LMTK3Q96Q04 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
LMTK3Q96Q04 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC41.04■■■■■ 4.16
LMTK3Q96Q04 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
LMTK3Q96Q04 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC41.02■■■■■ 4.16
LMTK3Q96Q04 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC41.02■■■■■ 4.16
LMTK3Q96Q04 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC41.02■■■■■ 4.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms