Protein–RNA interactions for Protein: Q96NJ1

Uncharacterized protein FLJ30774, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q96NJ1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q96NJ1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q96NJ1 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q96NJ1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q96NJ1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q96NJ1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q96NJ1 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q96NJ1 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q96NJ1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q96NJ1 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q96NJ1 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q96NJ1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q96NJ1 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q96NJ1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q96NJ1 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q96NJ1 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Q96NJ1 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q96NJ1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q96NJ1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q96NJ1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q96NJ1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q96NJ1 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q96NJ1 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q96NJ1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q96NJ1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q96NJ1 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q96NJ1 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q96NJ1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q96NJ1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q96NJ1 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q96NJ1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q96NJ1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q96NJ1 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q96NJ1 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q96NJ1 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q96NJ1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q96NJ1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q96NJ1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q96NJ1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q96NJ1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q96NJ1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q96NJ1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q96NJ1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q96NJ1 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Q96NJ1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Q96NJ1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q96NJ1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q96NJ1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q96NJ1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q96NJ1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q96NJ1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Q96NJ1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q96NJ1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q96NJ1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Q96NJ1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q96NJ1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q96NJ1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q96NJ1 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q96NJ1 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q96NJ1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q96NJ1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q96NJ1 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q96NJ1 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q96NJ1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q96NJ1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q96NJ1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q96NJ1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q96NJ1 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q96NJ1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q96NJ1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q96NJ1 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q96NJ1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q96NJ1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q96NJ1 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q96NJ1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q96NJ1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q96NJ1 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q96NJ1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Q96NJ1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q96NJ1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q96NJ1 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q96NJ1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q96NJ1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q96NJ1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q96NJ1 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q96NJ1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q96NJ1 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q96NJ1 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q96NJ1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q96NJ1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q96NJ1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Q96NJ1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Q96NJ1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q96NJ1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q96NJ1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q96NJ1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q96NJ1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q96NJ1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q96NJ1 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q96NJ1 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms