Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ2

CLMN, Calmin, humanhuman

Predictions only

Length 1,002 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMNQ96JQ2 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
CLMNQ96JQ2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
CLMNQ96JQ2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
CLMNQ96JQ2 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
CLMNQ96JQ2 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
CLMNQ96JQ2 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
CLMNQ96JQ2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
CLMNQ96JQ2 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
CLMNQ96JQ2 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
CLMNQ96JQ2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
CLMNQ96JQ2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
CLMNQ96JQ2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
CLMNQ96JQ2 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
CLMNQ96JQ2 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC33.21■■■□□ 2.91
CLMNQ96JQ2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC33.2■■■□□ 2.91
CLMNQ96JQ2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
CLMNQ96JQ2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
CLMNQ96JQ2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
CLMNQ96JQ2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
CLMNQ96JQ2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
CLMNQ96JQ2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
CLMNQ96JQ2 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
CLMNQ96JQ2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
CLMNQ96JQ2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
CLMNQ96JQ2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
CLMNQ96JQ2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
CLMNQ96JQ2 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
CLMNQ96JQ2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
CLMNQ96JQ2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
CLMNQ96JQ2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
CLMNQ96JQ2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
CLMNQ96JQ2 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
CLMNQ96JQ2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
CLMNQ96JQ2 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
CLMNQ96JQ2 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
CLMNQ96JQ2 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
CLMNQ96JQ2 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
CLMNQ96JQ2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
CLMNQ96JQ2 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
CLMNQ96JQ2 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC32.98■■■□□ 2.87
CLMNQ96JQ2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
CLMNQ96JQ2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC32.94■■■□□ 2.86
CLMNQ96JQ2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC32.93■■■□□ 2.86
CLMNQ96JQ2 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
CLMNQ96JQ2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
CLMNQ96JQ2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
CLMNQ96JQ2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
CLMNQ96JQ2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC32.89■■■□□ 2.86
CLMNQ96JQ2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
CLMNQ96JQ2 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
CLMNQ96JQ2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
CLMNQ96JQ2 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.83■■■□□ 2.85
CLMNQ96JQ2 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
CLMNQ96JQ2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
CLMNQ96JQ2 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
CLMNQ96JQ2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
CLMNQ96JQ2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
CLMNQ96JQ2 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC32.79■■■□□ 2.84
CLMNQ96JQ2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
CLMNQ96JQ2 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
CLMNQ96JQ2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.78■■■□□ 2.84
CLMNQ96JQ2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
CLMNQ96JQ2 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
CLMNQ96JQ2 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
CLMNQ96JQ2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
CLMNQ96JQ2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC32.75■■■□□ 2.83
CLMNQ96JQ2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
CLMNQ96JQ2 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
CLMNQ96JQ2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
CLMNQ96JQ2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
CLMNQ96JQ2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
CLMNQ96JQ2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
CLMNQ96JQ2 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
CLMNQ96JQ2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
CLMNQ96JQ2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
CLMNQ96JQ2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
CLMNQ96JQ2 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
CLMNQ96JQ2 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
CLMNQ96JQ2 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
CLMNQ96JQ2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC32.61■■■□□ 2.81
CLMNQ96JQ2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC32.61■■■□□ 2.81
CLMNQ96JQ2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
CLMNQ96JQ2 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
CLMNQ96JQ2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
CLMNQ96JQ2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
CLMNQ96JQ2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
CLMNQ96JQ2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
CLMNQ96JQ2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
CLMNQ96JQ2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
CLMNQ96JQ2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
CLMNQ96JQ2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
CLMNQ96JQ2 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
CLMNQ96JQ2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
CLMNQ96JQ2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
CLMNQ96JQ2 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
CLMNQ96JQ2 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
CLMNQ96JQ2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
CLMNQ96JQ2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
CLMNQ96JQ2 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.8
CLMNQ96JQ2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms