Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX1

SMIM12, Small integral membrane protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM12Q96EX1 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMIM12Q96EX1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMIM12Q96EX1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SMIM12Q96EX1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMIM12Q96EX1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMIM12Q96EX1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SMIM12Q96EX1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SMIM12Q96EX1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMIM12Q96EX1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMIM12Q96EX1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMIM12Q96EX1 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMIM12Q96EX1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMIM12Q96EX1 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMIM12Q96EX1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMIM12Q96EX1 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMIM12Q96EX1 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMIM12Q96EX1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMIM12Q96EX1 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMIM12Q96EX1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMIM12Q96EX1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMIM12Q96EX1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMIM12Q96EX1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMIM12Q96EX1 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMIM12Q96EX1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMIM12Q96EX1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMIM12Q96EX1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMIM12Q96EX1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMIM12Q96EX1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMIM12Q96EX1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMIM12Q96EX1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMIM12Q96EX1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMIM12Q96EX1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SMIM12Q96EX1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
SMIM12Q96EX1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SMIM12Q96EX1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SMIM12Q96EX1 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMIM12Q96EX1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
SMIM12Q96EX1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMIM12Q96EX1 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMIM12Q96EX1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMIM12Q96EX1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMIM12Q96EX1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
SMIM12Q96EX1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMIM12Q96EX1 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMIM12Q96EX1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMIM12Q96EX1 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMIM12Q96EX1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMIM12Q96EX1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SMIM12Q96EX1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SMIM12Q96EX1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SMIM12Q96EX1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SMIM12Q96EX1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SMIM12Q96EX1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SMIM12Q96EX1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SMIM12Q96EX1 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SMIM12Q96EX1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SMIM12Q96EX1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SMIM12Q96EX1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
SMIM12Q96EX1 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SMIM12Q96EX1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SMIM12Q96EX1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SMIM12Q96EX1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SMIM12Q96EX1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
SMIM12Q96EX1 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SMIM12Q96EX1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SMIM12Q96EX1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SMIM12Q96EX1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SMIM12Q96EX1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SMIM12Q96EX1 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SMIM12Q96EX1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SMIM12Q96EX1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SMIM12Q96EX1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMIM12Q96EX1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMIM12Q96EX1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SMIM12Q96EX1 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SMIM12Q96EX1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SMIM12Q96EX1 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMIM12Q96EX1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMIM12Q96EX1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMIM12Q96EX1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMIM12Q96EX1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMIM12Q96EX1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMIM12Q96EX1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMIM12Q96EX1 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMIM12Q96EX1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMIM12Q96EX1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SMIM12Q96EX1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SMIM12Q96EX1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SMIM12Q96EX1 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SMIM12Q96EX1 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SMIM12Q96EX1 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SMIM12Q96EX1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SMIM12Q96EX1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SMIM12Q96EX1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SMIM12Q96EX1 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SMIM12Q96EX1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SMIM12Q96EX1 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SMIM12Q96EX1 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMIM12Q96EX1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMIM12Q96EX1 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms