Protein–RNA interactions for Protein: Q93009

USP7, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP7Q93009 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
USP7Q93009 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
USP7Q93009 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
USP7Q93009 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
USP7Q93009 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
USP7Q93009 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
USP7Q93009 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
USP7Q93009 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
USP7Q93009 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
USP7Q93009 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
USP7Q93009 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
USP7Q93009 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
USP7Q93009 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
USP7Q93009 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
USP7Q93009 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
USP7Q93009 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
USP7Q93009 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
USP7Q93009 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
USP7Q93009 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
USP7Q93009 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
USP7Q93009 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
USP7Q93009 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP7Q93009 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP7Q93009 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP7Q93009 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
USP7Q93009 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP7Q93009 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
USP7Q93009 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
USP7Q93009 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
USP7Q93009 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
USP7Q93009 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
USP7Q93009 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
USP7Q93009 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
USP7Q93009 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP7Q93009 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
USP7Q93009 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP7Q93009 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
USP7Q93009 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
USP7Q93009 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP7Q93009 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP7Q93009 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP7Q93009 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
USP7Q93009 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
USP7Q93009 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
USP7Q93009 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP7Q93009 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP7Q93009 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP7Q93009 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP7Q93009 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP7Q93009 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP7Q93009 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP7Q93009 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP7Q93009 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
USP7Q93009 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27■■□□□ 1.91
USP7Q93009 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
USP7Q93009 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
USP7Q93009 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
USP7Q93009 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
USP7Q93009 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
USP7Q93009 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
USP7Q93009 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
USP7Q93009 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP7Q93009 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
USP7Q93009 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
USP7Q93009 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
USP7Q93009 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
USP7Q93009 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
USP7Q93009 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
USP7Q93009 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
USP7Q93009 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
USP7Q93009 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
USP7Q93009 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
USP7Q93009 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP7Q93009 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP7Q93009 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
USP7Q93009 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP7Q93009 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP7Q93009 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP7Q93009 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP7Q93009 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
USP7Q93009 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
USP7Q93009 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
USP7Q93009 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
USP7Q93009 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
USP7Q93009 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP7Q93009 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP7Q93009 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP7Q93009 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
USP7Q93009 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
USP7Q93009 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP7Q93009 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP7Q93009 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP7Q93009 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP7Q93009 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP7Q93009 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP7Q93009 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP7Q93009 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP7Q93009 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP7Q93009 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP7Q93009 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms