Protein–RNA interactions for Protein: Q93008

USP9X, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9XQ93008 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP9XQ93008 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP9XQ93008 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP9XQ93008 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP9XQ93008 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
USP9XQ93008 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP9XQ93008 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP9XQ93008 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP9XQ93008 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP9XQ93008 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP9XQ93008 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP9XQ93008 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP9XQ93008 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
USP9XQ93008 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
USP9XQ93008 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
USP9XQ93008 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP9XQ93008 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
USP9XQ93008 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP9XQ93008 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP9XQ93008 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP9XQ93008 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP9XQ93008 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP9XQ93008 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP9XQ93008 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
USP9XQ93008 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP9XQ93008 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP9XQ93008 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP9XQ93008 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP9XQ93008 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP9XQ93008 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
USP9XQ93008 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP9XQ93008 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP9XQ93008 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP9XQ93008 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP9XQ93008 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
USP9XQ93008 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP9XQ93008 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP9XQ93008 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP9XQ93008 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP9XQ93008 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP9XQ93008 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.6
USP9XQ93008 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.6
USP9XQ93008 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP9XQ93008 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP9XQ93008 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP9XQ93008 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
USP9XQ93008 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
USP9XQ93008 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP9XQ93008 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
USP9XQ93008 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP9XQ93008 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP9XQ93008 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP9XQ93008 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP9XQ93008 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP9XQ93008 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP9XQ93008 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP9XQ93008 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP9XQ93008 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP9XQ93008 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP9XQ93008 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP9XQ93008 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP9XQ93008 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP9XQ93008 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP9XQ93008 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP9XQ93008 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP9XQ93008 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP9XQ93008 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP9XQ93008 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP9XQ93008 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP9XQ93008 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP9XQ93008 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
USP9XQ93008 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
USP9XQ93008 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP9XQ93008 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP9XQ93008 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP9XQ93008 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP9XQ93008 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP9XQ93008 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP9XQ93008 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP9XQ93008 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP9XQ93008 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
USP9XQ93008 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP9XQ93008 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP9XQ93008 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP9XQ93008 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP9XQ93008 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP9XQ93008 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP9XQ93008 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP9XQ93008 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP9XQ93008 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP9XQ93008 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP9XQ93008 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP9XQ93008 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP9XQ93008 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP9XQ93008 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP9XQ93008 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
USP9XQ93008 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP9XQ93008 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP9XQ93008 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP9XQ93008 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.5 ms